Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:147013308" >
Experiences and les...
Experiences and lessons learned from two virtual, hands-on microbiome bioinformatics workshops
- Artikel/kapitelEngelska2021
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2021-06-24
-
Public Library of Science (PLoS),2021
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:147013308
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:147013308URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009056DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
In October of 2020, in response to the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic, our team hosted our first fully online workshop teaching the QIIME 2 microbiome bioinformatics platform. We had 75 enrolled participants who joined from at least 25 different countries on 6 continents, and we had 22 instructors on 4 continents. In the 5-day workshop, participants worked hands-on with a cloud-based shared compute cluster that we deployed for this course. The event was well received, and participants provided feedback and suggestions in a postworkshop questionnaire. In January of 2021, we followed this workshop with a second fully online workshop, incorporating lessons from the first. Here, we present details on the technology and protocols that we used to run these workshops, focusing on the first workshop and then introducing changes made for the second workshop. We discuss what worked well, what didn’t work well, and what we plan to do differently in future workshops.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Bolyen, E
(författare)
-
Adamov, A
(författare)
-
Belk, A
(författare)
-
Borsom, E
(författare)
-
Burcham, Z
(författare)
-
Debelius, JWKarolinska Institutet
(författare)
-
Deel, H
(författare)
-
Emmons, A
(författare)
-
Estaki, M
(författare)
-
Herman, C
(författare)
-
Keefe, CR
(författare)
-
Morton, JT
(författare)
-
Oliveira, RRM
(författare)
-
Sanchez, A
(författare)
-
Simard, A
(författare)
-
Vazquez-Baeza, Y
(författare)
-
Ziemski, M
(författare)
-
Miwa, HE
(författare)
-
Kerere, TA
(författare)
-
Coote, C
(författare)
-
Bonneau, R
(författare)
-
Knight, R
(författare)
-
Oliveira, G
(författare)
-
Gopalasingam, P
(författare)
-
Kaehler, BD
(författare)
-
Cope, EK
(författare)
-
Metcalf, JL
(författare)
-
Robeson, MS
(författare)
-
Bokulich, NA
(författare)
-
Caporaso, JG
(författare)
-
Karolinska Institutet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLoS computational biology: Public Library of Science (PLoS)17:6, s. e1009056-1553-7358
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Dillon, MR
-
Bolyen, E
-
Adamov, A
-
Belk, A
-
Borsom, E
-
Burcham, Z
-
visa fler...
-
Debelius, JW
-
Deel, H
-
Emmons, A
-
Estaki, M
-
Herman, C
-
Keefe, CR
-
Morton, JT
-
Oliveira, RRM
-
Sanchez, A
-
Simard, A
-
Vazquez-Baeza, Y
-
Ziemski, M
-
Miwa, HE
-
Kerere, TA
-
Coote, C
-
Bonneau, R
-
Knight, R
-
Oliveira, G
-
Gopalasingam, P
-
Kaehler, BD
-
Cope, EK
-
Metcalf, JL
-
Robeson, MS
-
Bokulich, NA
-
Caporaso, JG
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS computation ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet