Sökning: ((WFRF:(Fellay J)) srt2:(2022)) >
Rare predicted loss...
Rare predicted loss-of-function variants of type I IFN immunity genes are associated with life-threatening COVID-19
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Cold Spring Harbor Laboratory,2022
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:236324795
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:236324795URI
-
https://doi.org/10.1101/2022.10.22.22281221DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:vet swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
BackgroundWe previously reported inborn errors of TLR3- and TLR7-dependent type I interferon (IFN) immunity in 1-5% of unvaccinated patients with life-threatening COVID-19, and auto-antibodies against type I IFN in another 15-20% of cases.MethodsWe report here a genome-wide rare variant burden association analysis in 3,269 unvaccinated patients with life-threatening COVID-19 (1,301 previously reported and 1,968 new patients), and 1,373 unvaccinated SARS-CoV-2-infected individuals without pneumonia. A quarter of the patients tested had antibodies against type I IFN (234 of 928) and were excluded from the analysis.ResultsNo gene reached genome-wide significance. Under a recessive model, the most significant gene with at-risk variants wasTLR7, with an OR of 27.68 (95%CI:1.5-528.7,P=1.1×10−4), in analyses restricted to biochemically loss-of-function (bLOF) variants. We replicated the enrichment in rare predicted LOF (pLOF) variants at 13 influenza susceptibility loci involved in TLR3-dependent type I IFN immunity (OR=3.70 [95%CI:1.3-8.2],P=2.1×10−4). Adding the recently reportedTYK2COVID-19 locus strengthened this enrichment, particularly under a recessive model (OR=19.65 [95%CI:2.1-2635.4];P=3.4×10−3). When these 14 loci andTLR7were considered, all individuals hemizygous (n=20) or homozygous (n=5) for pLOF or bLOF variants were patients (OR=39.19 [95%CI:5.2-5037.0],P=4.7×10−7), who also showed an enrichment in heterozygous variants (OR=2.36 [95%CI:1.0-5.9],P=0.02). Finally, the patients with pLOF or bLOF variants at these 15 loci were significantly younger (mean age [SD]=43.3 [20.3] years) than the other patients (56.0 [17.3] years;P=1.68×10−5).ConclusionsRare variants of TLR3- and TLR7-dependent type I IFN immunity genes can underlie life-threatening COVID-19, particularly with recessive inheritance, in patients under 60 years old.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Talouarn, E
(författare)
-
Marchal, A
(författare)
-
Manry, J
(författare)
-
Seeleuthner, Y
(författare)
-
Zhang, Y
(författare)
-
Bolze, A
(författare)
-
Chaldebas, M
(författare)
-
Milisavljevic, B
(författare)
-
Zhang, P
(författare)
-
Gervais, A
(författare)
-
Bastard, P
(författare)
-
Asano, T
(författare)
-
Bizien, L
(författare)
-
Barzaghi, F
(författare)
-
Abolhassani, HKarolinska Institutet
(författare)
-
Tayoun, AA
(författare)
-
Aiuti, A
(författare)
-
Darazam, IA
(författare)
-
Allende, LM
(författare)
-
Alonso-Arias, R
(författare)
-
Arias, AA
(författare)
-
Aytekin, G
(författare)
-
Bergman, P
(författare)
-
Bondesan, S
(författare)
-
Bryceson, YT
(författare)
-
Bustos, IG
(författare)
-
Cabrera-Marante, O
(författare)
-
Carcel, S
(författare)
-
Carrera, P
(författare)
-
Casari, G
(författare)
-
Chaïbi, K
(författare)
-
Colobran, R
(författare)
-
Condino-Neto, A
(författare)
-
Covill, LE
(författare)
-
El Zein, L
(författare)
-
Flores, C
(författare)
-
Gregersen, PK
(författare)
-
Gut, M
(författare)
-
Haerynck, F
(författare)
-
Halwani, R
(författare)
-
Hancerli, S
(författare)
-
Hammarström, L
(författare)
-
Hatipoğlu, N
(författare)
-
Karbuz, A
(författare)
-
Keles, S
(författare)
-
Kyheng, C
(författare)
-
Leon-Lopez, R
(författare)
-
Franco, JL
(författare)
-
Mansouri, D
(författare)
-
Martinez-Picado, J
(författare)
-
Akcan, OM
(författare)
-
Migeotte, I
(författare)
-
Morange, PE
(författare)
-
Morelle, G
(författare)
-
Martin-Nalda, A
(författare)
-
Novelli, G
(författare)
-
Novelli, A
(författare)
-
Ozcelik, T
(författare)
-
Palabiyik, F
(författare)
-
Pan-Hammarström, Q
(författare)
-
Pérez de Diego, R
(författare)
-
Planas-Serra, L
(författare)
-
Pleguezuelo, DE
(författare)
-
Prando, C
(författare)
-
Pujol, A
(författare)
-
Reyes, LF
(författare)
-
Rivière, JG
(författare)
-
Rodriguez-Gallego, C
(författare)
-
Rojas, J
(författare)
-
Rovere-Querini, P
(författare)
-
Schlüter, A
(författare)
-
Shahrooei, M
(författare)
-
Sobh, A
(författare)
-
Soler-Palacin, P
(författare)
-
Tandjaoui-Lambiotte, Y
(författare)
-
Tipu, I
(författare)
-
Tresoldi, C
(författare)
-
Troya, J
(författare)
-
van de Beek, D
(författare)
-
Zatz, M
(författare)
-
Zawadzki, P
(författare)
-
Al-Muhsen, SZ
(författare)
-
Baris-Feldman, H
(författare)
-
Butte, MJ
(författare)
-
Constantinescu, SN
(författare)
-
Cooper, MA
(författare)
-
Dalgard, CL
(författare)
-
Fellay, J
(författare)
-
Heath, JR
(författare)
-
Lau, YL
(författare)
-
Lifton, RP
(författare)
-
Maniatis, T
(författare)
-
Mogensen, TH
(författare)
-
von Bernuth, H
(författare)
-
Lermine, A
(författare)
-
Vidaud, M
(författare)
-
Boland, A
(författare)
-
Deleuze, JF
(författare)
-
Nussbaum, R
(författare)
-
Kahn-Kirby, A
(författare)
-
Mentre, F
(författare)
-
Tubiana, S
(författare)
-
Gorochov, G
(författare)
-
Tubach, F
(författare)
-
Hausfater, P
(författare)
-
Meyts, I
(författare)
-
Zhang, SY
(författare)
-
Puel, A
(författare)
-
Notarangelo, LD
(författare)
-
Boisson-Dupuis, S
(författare)
-
Su, HC
(författare)
-
Boisson, B
(författare)
-
Jouanguy, E
(författare)
-
Casanova, JL
(författare)
-
Zhang, Q
(författare)
-
Abel, L
(författare)
-
Cobat, A
(författare)
-
Karolinska Institutet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:medRxiv : the preprint server for health sciences: Cold Spring Harbor Laboratory
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Matuozzo, D
-
Talouarn, E
-
Marchal, A
-
Manry, J
-
Seeleuthner, Y
-
Zhang, Y
-
visa fler...
-
Bolze, A
-
Chaldebas, M
-
Milisavljevic, B
-
Zhang, P
-
Gervais, A
-
Bastard, P
-
Asano, T
-
Bizien, L
-
Barzaghi, F
-
Abolhassani, H
-
Tayoun, AA
-
Aiuti, A
-
Darazam, IA
-
Allende, LM
-
Alonso-Arias, R
-
Arias, AA
-
Aytekin, G
-
Bergman, P
-
Bondesan, S
-
Bryceson, YT
-
Bustos, IG
-
Cabrera-Marante, ...
-
Carcel, S
-
Carrera, P
-
Casari, G
-
Chaïbi, K
-
Colobran, R
-
Condino-Neto, A
-
Covill, LE
-
El Zein, L
-
Flores, C
-
Gregersen, PK
-
Gut, M
-
Haerynck, F
-
Halwani, R
-
Hancerli, S
-
Hammarström, L
-
Hatipoğlu, N
-
Karbuz, A
-
Keles, S
-
Kyheng, C
-
Leon-Lopez, R
-
Franco, JL
-
Mansouri, D
-
Martinez-Picado, ...
-
Akcan, OM
-
Migeotte, I
-
Morange, PE
-
Morelle, G
-
Martin-Nalda, A
-
Novelli, G
-
Novelli, A
-
Ozcelik, T
-
Palabiyik, F
-
Pan-Hammarström, ...
-
Pérez de Diego, ...
-
Planas-Serra, L
-
Pleguezuelo, DE
-
Prando, C
-
Pujol, A
-
Reyes, LF
-
Rivière, JG
-
Rodriguez-Galleg ...
-
Rojas, J
-
Rovere-Querini, ...
-
Schlüter, A
-
Shahrooei, M
-
Sobh, A
-
Soler-Palacin, P
-
Tandjaoui-Lambio ...
-
Tipu, I
-
Tresoldi, C
-
Troya, J
-
van de Beek, D
-
Zatz, M
-
Zawadzki, P
-
Al-Muhsen, SZ
-
Baris-Feldman, H
-
Butte, MJ
-
Constantinescu, ...
-
Cooper, MA
-
Dalgard, CL
-
Fellay, J
-
Heath, JR
-
Lau, YL
-
Lifton, RP
-
Maniatis, T
-
Mogensen, TH
-
von Bernuth, H
-
Lermine, A
-
Vidaud, M
-
Boland, A
-
Deleuze, JF
-
Nussbaum, R
-
Kahn-Kirby, A
-
Mentre, F
-
Tubiana, S
-
Gorochov, G
-
Tubach, F
-
Hausfater, P
-
Meyts, I
-
Zhang, SY
-
Puel, A
-
Notarangelo, LD
-
Boisson-Dupuis, ...
-
Su, HC
-
Boisson, B
-
Jouanguy, E
-
Casanova, JL
-
Zhang, Q
-
Abel, L
-
Cobat, A
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
- medRxiv : the pr ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet