Discovery and implementation of a novel pathway for n-butanol production via 2-oxoglutarate

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:0abd9622-445c-45f6-9acf-0a84a02a8cbd" > Discovery and imple...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Ferreira, SofiaUniversidade do Minho,University of Minho (författare)

Discovery and implementation of a novel pathway for n-butanol production via 2-oxoglutarate

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2019-09-30
Springer Science and Business Media LLC,2019
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:0abd9622-445c-45f6-9acf-0a84a02a8cbd
https://research.chalmers.se/publication/512890URI
https://doi.org/10.1186/s13068-019-1565-xDOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

Background : One of the European Union directives indicates that 10% of all fuels must be bio-synthesized by 2020. In this regard, biobutanol - natively produced by clostridial strains - poses as a promising alternative biofuel. One possible approach to overcome the difficulties of the industrial exploration of the native producers is the expression of more suitable pathways in robust microorganisms such as Escherichia coli. The enumeration of novel pathways is a powerful tool, allowing to identify non-obvious combinations of enzymes to produce a target compound. Results : This work describes the in silico driven design of E. coli strains able to produce butanol via 2-oxoglutarate by a novel pathway. This butanol pathway was generated by a hypergraph algorithm and selected from an initial set of 105,954 different routes by successively applying different filters, such as stoichiometric feasibility, size and novelty. The implementation of this pathway involved seven catalytic steps and required the insertion of nine heterologous genes from various sources in E. coli distributed in three plasmids. Expressing butanol genes in E. coli K12 and cultivation in High-Density Medium formulation seem to favor butanol accumulation via the 2-oxoglutarate pathway. The maximum butanol titer obtained was 85 ± 1 mg L-1 by cultivating the cells in bioreactors. Conclusions : In this work, we were able to successfully translate the computational analysis into in vivo applications, designing novel strains of E. coli able to produce n-butanol via an innovative pathway. Our results demonstrate that enumeration algorithms can broad the spectrum of butanol producing pathways. This validation encourages further research to other target compounds.

Ämnesord och genrebeteckningar

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Industriell bioteknik Bioprocessteknik hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Industrial Biotechnology Bioprocess Technology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng
2-Oxoglutarate
E. coli
n-Butanol
Metabolic engineering
Enumeration algorithms

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Pereira, Rui,1986Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)ruip (författare)
Liu, FilipeArgonne National Laboratory,Universidade do Minho,University of Minho (författare)
Vilaca, P. (författare)
Rocha, I.Nova University of Lisbon, Portugal,Universidade do Minho,University of Minho (författare)
Universidade do MinhoChalmers tekniska högskola (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Biotechnology for Biofuels: Springer Science and Business Media LLC12:11754-68341754-6834

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Biotechnology for Biofuels (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Ferreira, Sofia; Pereira, Rui, 19 ...; Liu, Filipe; Vilaca, P.; Rocha, I.

Om ämnet

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Industriell biot ...; och Bioprocessteknik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Bioinformatik oc ...

Artiklar i publikationen: Biotechnology fo ...

Av lärosätet: Chalmers tekniska högskola

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se