Sökning: WFRF:(Garcia Bonete Maria Jose 1989) >
Clustering of atomi...
Clustering of atomic displacement parameters in bovine trypsin reveals a distributed lattice of atoms with shared chemical properties
-
- Ahlberg Gagnér, Viktor, 1989 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg, Sweden
-
- Lundholm, Ida, 1986 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg, Sweden
-
- Garcia-Bonete, Maria-Jose, 1989 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg, Sweden
-
visa fler...
-
- Rodilla, Helena, 1982 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Chalmers University of Technology, Sweden
-
- Friedman, Ran (författare)
- Linnéuniversitetet,Institutionen för kemi och biomedicin (KOB),Avancerade material,Linnaeus Ctr Biomat Chem, BMC;CCBG
-
- Zhaunerchyk, Vitali, 1981 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU),University of Gothenburg, Sweden
-
- Bourenkov, Gleb (författare)
- European Molecular Biology Laboratory,DESY, Germany
-
- Schneider, Thomas (författare)
- European Molecular Biology Laboratory,DESY, Germany
-
- Stake, Jan, 1971 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Chalmers University of Technology, Sweden
-
- Katona, Gergely, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-12-17
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322 .- 2045-2322. ; 9:1
- Relaterad länk:
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://research.cha...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Low-frequency vibrations are crucial for protein structure and function, but only a few experimental techniques can shine light on them. The main challenge when addressing protein dynamics in the terahertz domain is the ubiquitous water that exhibit strong absorption. In this paper, we observe the protein atoms directly using X-ray crystallography in bovine trypsin at 100 K while irradiating the crystals with 0.5 THz radiation alternating on and off states. We observed that the anisotropy of atomic displacements increased upon terahertz irradiation. Atomic displacement similarities developed between chemically related atoms and between atoms of the catalytic machinery. This pattern likely arises from delocalized polar vibrational modes rather than delocalized elastic deformations or rigid-body displacements. The displacement correlation between these atoms were detected by a hierarchical clustering method, which can assist the analysis of other ultra-high resolution crystal structures. These experimental and analytical tools provide a detailed description of protein dynamics to complement the structural information from static diffraction experiments. © 2019, The Author(s).
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biofysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Elektroteknik och elektronik -- Annan elektroteknik och elektronik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Electrical Engineering, Electronic Engineering, Information Engineering -- Other Electrical Engineering, Electronic Engineering, Information Engineering (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Strukturbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Structural Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Den kondenserade materiens fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Condensed Matter Physics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Kemi -- Fysikalisk kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences -- Physical Chemistry (hsv//eng)
Nyckelord
- Fysikalisk kemi
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ahlberg Gagnér, ...
-
Lundholm, Ida, 1 ...
-
Garcia-Bonete, M ...
-
Rodilla, Helena, ...
-
Friedman, Ran
-
Zhaunerchyk, Vit ...
-
visa fler...
-
Bourenkov, Gleb
-
Schneider, Thoma ...
-
Stake, Jan, 1971
-
Katona, Gergely, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biofysik
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Elektroteknik oc ...
-
och Annan elektrotek ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Strukturbiologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
och Den kondenserade ...
-
visa fler...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Kemi
-
och Fysikalisk kemi
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Repor ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Göteborgs universitet
-
Linnéuniversitetet