The mobile FOX AmpC beta-lactamases originated in Aeromonas allosaccharophila

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: L773:1872 7913 > The mobile FOX AmpC...

Ebmeyer, Stefan,1990Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine (författare)

The mobile FOX AmpC beta-lactamases originated in Aeromonas allosaccharophila

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2019
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:ba385847-b42a-42f9-ad9c-6b7911153699
https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2019.09.017DOI
https://research.chalmers.se/publication/514186URI
https://gup.ub.gu.se/publication/287727URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

Objective: It is important to understand the origins of antibiotic resistance genes so that risks associated with the emergence of novel resistance genes can be assessed and managed. The chromosomal ampC gene (CAV-1) of Aeromonas caviae (A. caviae) has been reported as the origin of mobile FOX cephalosporinases. The recent identification of A. caviae as the origin of MOX-2 cephalosporinases and the comparably great sequence divergence between FOX and MOX genes makes it unlikely that both genes arose from the same species. Therefore, this study investigated the origin of FOX cephalosporinases using large-scale genomics. Methods: Publicly available genomes and plasmids were searched for FOX-like genes. Synteny and nucleotide identities of the identified FOX-like genes and their genetic environments were compared and a phylogenetic tree was generated. Results: FOX-like genes were identified in > 230 Aeromonas genomes and in 46 Enterobacteriaceae isolates. Analysis of the genomic context of CAV-1 revealed a truncated insertion sequence directly upstream of the ampC gene. The chromosomal ampCs of A. caviae (n = 31) were 75–78% identical to CAV-1. In contrast, CAV-1, mobile FOX genes and their context were 95–98% similar to the chromosomal ampC-locus of Aeromonas allosaccharophila (A. allosaccharophila) (n = 6). The A. allosaccharophila ampCs formed a monophyletic branch with mobile FOX genes, whereas the A. caviae ampCs clustered with mobile MOX genes. Conclusions: These findings show that FOX cephalosporinases originate not in A. caviae, as previously reported, but in A. allosaccharophila, which is a fish pathogen. This finding agrees with the hypothesis that antibiotic use in aquaculture could have contributed to the emergence of FOX genes in human pathogens.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Evolutionsbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Evolutionary Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
AmpC
FOX
Aeromonas
Antibiotic resistance
Aeromonas
AmpC
Antibiotic resistance
FOX

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Kristiansson, Erik,1978Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences(Swepub:gu)xkrier (författare)
Larsson, D. G. Joakim,1969Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine(Swepub:gu)xlarjo (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:International Journal of Antimicrobial Agents: Elsevier BV54:6, s. 798-8021872-79130924-8579

Internetlänk

Hitta via bibliotek

International Journal of Antimicrobial Agents (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Ebmeyer, Stefan, ...; Kristiansson, Er ...; Larsson, D. G. J ...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Evolutionsbiolog ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Bioinformatik oc ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

Artiklar i publikationen: International Jo ...

Av lärosätet: Chalmers tekniska högskola; Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se