Extensive Trans-Specific Polymorphism at the Mating Type Locus of the Root Decay Fungus Heterobasidion

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:slubar.slu.se:52205" > Extensive Trans-Spe...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Olson, ÅkeSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Department of Forest Mycology and Plant Pathology (författare)

Extensive Trans-Specific Polymorphism at the Mating Type Locus of the Root Decay Fungus Heterobasidion

Artikel/kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2013-07-17
Oxford University Press (OUP),2013
Oxford University Press (OUP): Molecular Biology and Evolution,2024

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:slubar.slu.se:52205
https://res.slu.se/id/publ/52205URI
https://doi.org/10.1093/molbev/mst126DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Incompatibility systems in which individuals bearing identical alleles reject each other favor the maintenance of a diversity of alleles. Mushroom mating type loci (MAT) encode for dozens or hundreds of incompatibility alleles whose loss from the population is greatly restricted through negative frequency selection, leading to a system of alleles with highly divergent sequences. Here, we use DNA sequences of homeodomain (HD) encoding genes at the MAT locus of five closely related species of the root rot basidiomycete Heterobasidion annosum sensu lato to show that the extended coalescence time of MAT alleles greatly predates speciation in the group, contrasting loci outside of MAT that show allele divergences largely consistent with the species phylogeny with those of MAT, which show rampant trans-species polymorphism. We observe a roughly 6-fold greater genealogical depth and polymorphism of MAT compared with non-MAT that argues for the maintenance of balanced polymorphism for a minimum duration of 24 My based on a molecular-clock calibrated species phylogeny. As with other basidiomycete HD genes, balancing selection appears to be concentrated at the specificity-determining region in the N-terminus of the protein based on identification of codons under selection and the absence of recombination within the region. However, the elevated polymorphism extends into the nonspecificity determining regions as well as a neighboring non-MAT gene, the mitochondrial intermediate peptidase (MIP). In doing so, increased divergence should decrease recombination among alleles and as a by-product create incompatibilities in the functional domains not involved in allele recognition but in regulating sexual development.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Evolutionsbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Evolutionary Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Ihrmark, KatarinaSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Department of Forest Mycology and Plant Pathology(Swepub:slu)48691 (författare)
Stenlid, JanSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig mykologi och patologi,Department of Forest Mycology and Pathology(Swepub:slu)46689 (författare)
James, Timothy Y (författare)
Sveriges lantbruksuniversitetDepartment of Forest Mycology and Plant Pathology (creator_code:org_t)
Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

Ingår i:Molecular Biology and Evolution: Oxford University Press (OUP)30, s. 2286-23010737-40381537-1719

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Molecular Biology and Evolution (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Olson, Åke; Ihrmark, Katarin ...; Stenlid, Jan; James, Timothy Y

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Evolutionsbiolog ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

Artiklar i publikationen: Molecular Biolog ...

Av lärosätet: Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se