SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

AMNE:(LANTBRUKSVETENSKAPER Bioteknologi med applikationer på växter och djur)
 

Sökning: AMNE:(LANTBRUKSVETENSKAPER Bioteknologi med applikationer på växter och djur) > (2010-2014) > Genome Analysis of ...

  • Niazi, AdnanSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics (författare)

Genome Analysis of Bacillus amyloliquefaciens Subsp. plantarum UCMB5113: A Rhizobacterium That Improves Plant Growth and Stress Management

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2014-08-13
  • Public Library of Science (PLoS),2014
  • Public Library of Science,2024

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:slubar.slu.se:60043
  • https://res.slu.se/id/publ/60043URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0104651DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum strain UCMB5113 is a Gram-positive rhizobacterium that can colonize plant roots and stimulate plant growth and defense based on unknown mechanisms. This reinforcement of plants may provide protection to various forms of biotic and abiotic stress. To determine the genetic traits involved in the mechanism of plantbacteria association, the genome sequence of UCMB5113 was obtained by assembling paired-end Illumina reads. The assembled chromosome of 3,889,532 bp was predicted to encode 3,656 proteins. Genes that potentially contribute to plant growth promotion such as indole-3-acetic acid (IAA) biosynthesis, acetoin synthesis and siderophore production were identified. Moreover, annotation identified putative genes responsible for non-ribosomal synthesis of secondary metabolites and genes supporting environment fitness of UCMB5113 including drug and metal resistance. A large number of genes encoding a diverse set of secretory proteins, enzymes of primary and secondary metabolism and carbohydrate active enzymes were found which reflect a high capacity to degrade various rhizosphere macromolecules. Additionally, many predicted membrane transporters provides the bacterium with efficient uptake capabilities of several nutrients. Although, UCMB5113 has the possibility to produce antibiotics and biosurfactants, the protective effect of plants to pathogens seems to be indirect and due to priming of plant induced systemic resistance. The availability of the genome enables identification of genes and their function underpinning beneficial interactions of UCMB5113 with plants.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Manzoor, ShahidSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,University of the Punjab(Swepub:slu)49118 (författare)
  • Asari, ShashidarSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)49091 (författare)
  • Bejai, SaroshSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)47284 (författare)
  • Meijer, JohanSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)49506 (författare)
  • Bongcam Rudloff, ErikSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics(Swepub:slu)50410 (författare)
  • Sveriges lantbruksuniversitetInstitutionen för husdjursgenetik (HGEN) (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS ONE: Public Library of Science (PLoS)91932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy