Sökning: WFRF:(Ji Xinyu)
> (2022) >
Epigenome-wide thre...
Epigenome-wide three-way interaction study identifies a complex pattern between TRIM27, KIAA0226, and smoking associated with overall survival of early-stage NSCLC
-
- Ji, Xinyu (författare)
- Nanjing Medical University
-
- Lin, Lijuan (författare)
- Nanjing Medical University
-
- Fan, Juanjuan (författare)
- Nanjing Medical University
-
visa fler...
-
- Li, Yi (författare)
- University of Michigan
-
- Wei, Yongyue (författare)
- Nanjing Medical University,Harvard University
-
- Shen, Sipeng (författare)
- Nanjing Medical University
-
- Su, Li (författare)
- Harvard University
-
- Shafer, Andrea (författare)
- Massachusetts General Hospital
-
- Bjaanæs, Maria Moksnes (författare)
- Oslo university hospital
-
- Karlsson, Anna (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
-
- Planck, Maria (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
-
- Staaf, Johan (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Department of Clinical Sciences, Lund
-
- Helland, Åslaug (författare)
- Oslo university hospital,University of Oslo
-
- Esteller, Manel (författare)
- Josep Carreras Leukaemia Research Institute (IJC),Catalan Institution for Research and Advanced Studies,Spanish Center for Biomedical Research Network in Oncology (CIBERONC),University of Barcelona
-
- Zhang, Ruyang (författare)
- Harvard University,Nanjing Medical University
-
- Chen, Feng (författare)
- Nanjing Medical University
-
- Christiani, David C. (författare)
- Massachusetts General Hospital,Harvard University
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-01-07
- 2022
- Engelska 15 s.
-
Ingår i: Molecular Oncology. - : Wiley. - 1574-7891 .- 1878-0261. ; 16:3, s. 717-731
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The interaction between DNA methylation of tripartite motif containing 27 (cg05293407TRIM27) and smoking has previously been identified to reveal histologically heterogeneous effects of TRIM27 DNA methylation on early-stage non-small-cell lung cancer (NSCLC) survival. However, to understand the complex mechanisms underlying NSCLC progression, we searched three-way interactions. A two-phase study was adopted to identify three-way interactions in the form of pack-year of smoking (number of cigarettes smoked per day × number of years smoked) × cg05293407TRIM27 × epigenome-wide DNA methylation CpG probe. Two CpG probes were identified with FDR-q ≤ 0.05 in the discovery phase and P ≤ 0.05 in the validation phase: cg00060500KIAA0226 and cg17479956EXT2. Compared to a prediction model with only clinical information, the model added 42 significant three-way interactions using a looser criterion (discovery: FDR-q ≤ 0.10, validation: P ≤ 0.05) had substantially improved the area under the receiver operating characteristic curve (AUC) of the prognostic prediction model for both 3-year and 5-year survival. Our research identified the complex interaction effects among multiple environment and epigenetic factors, and provided therapeutic target for NSCLC patients.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ji, Xinyu
-
Lin, Lijuan
-
Fan, Juanjuan
-
Li, Yi
-
Wei, Yongyue
-
Shen, Sipeng
-
visa fler...
-
Su, Li
-
Shafer, Andrea
-
Bjaanæs, Maria M ...
-
Karlsson, Anna
-
Planck, Maria
-
Staaf, Johan
-
Helland, Åslaug
-
Esteller, Manel
-
Zhang, Ruyang
-
Chen, Feng
-
Christiani, Davi ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular Oncolo ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet