SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Parniewski Pawel)
 

Sökning: WFRF:(Parniewski Pawel) > Predicting pathogen...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003840naa a2200493 4500
001oai:DiVA.org:liu-145810
003SwePub
008180321s2018 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:DiVA.org:uu-341023
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-1458102 URI
0247 a https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.10059312 DOI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-3410232 URI
040 a (SwePub)liud (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Bartoszek, Krzysztofu Linköpings universitet,Statistik och maskininlärning,Filosofiska fakulteten,Uppsala Univ, Sweden4 aut0 (Swepub:liu)krzba67
2451 0a Predicting pathogenicity behavior in Escherichia coli population through a state dependent model and TRS profiling
264 c 2018-01-31
264 1b PUBLIC LIBRARY SCIENCE,c 2018
338 a electronic2 rdacarrier
500 a Funding Agencies|IMB PAS as part of the statutory research; Knut and Alice Wallenberg Foundation
520 a The Binary State Speciation and Extinction (BiSSE) model is a branching process based model that allows the diversification rates to be controlled by a binary trait. We develop a general approach, based on the BiSSE model, for predicting pathogenicity in bacterial populations from microsatellites profiling data. A comprehensive approach for predicting pathogenicity in E. coli populations is proposed using the state-dependent branching process model combined with microsatellites TRS-PCR profiling. Additionally, we have evaluated the possibility of using the BiSSE model for estimating parameters from genetic data. We analyzed a real dataset (from 251 E. coli strains) and confirmed previous biological observations demonstrating a prevalence of some virulence traits in specific bacterial sub-groups. The method may be used to predict pathogenicity of other bacterial taxa.
650 7a NATURVETENSKAPx Data- och informationsvetenskapx Bioinformatik0 (SwePub)102032 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Computer and Information Sciencesx Bioinformatics0 (SwePub)102032 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Bioinformatik och systembiologi0 (SwePub)106102 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Bioinformatics and Systems Biology0 (SwePub)106102 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Matematikx Sannolikhetsteori och statistik0 (SwePub)101062 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Mathematicsx Probability Theory and Statistics0 (SwePub)101062 hsv//eng
7001 a Majchrzak, Martau Polish Acad Sci, Poland4 aut
7001 a Sakowski, Sebastianu Univ Lodz, Poland4 aut
7001 a Kubiak-Szeligowska, Anna B.u Polish Acad Sci, Poland4 aut
7001 a Kaj, Ingemar,d 1957-u Uppsala universitet,Analys och sannolikhetsteori,Analysis and Probability,Uppsala Univ, Sweden4 aut0 (Swepub:uu)ingekaj
7001 a Parniewski, Pawelu Polish Acad Sci, Poland4 aut
7102 a Linköpings universitetb Statistik och maskininlärning4 org
7730 t PloS Computational Biologyd : PUBLIC LIBRARY SCIENCEg 14:1q 14:1x 1553-734Xx 1553-7358
8564 u https://liu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1192180/FULLTEXT01.pdfx primaryx Raw objecty fulltext:print
8564 u https://journals.plos.org/ploscompbiol/article/file?id=10.1371/journal.pcbi.1005931&type=printable
8564 u https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005931y Fulltext
8564 u https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1180606/FULLTEXT01.pdfx primaryx Raw objecty fulltext:print
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-145810
8564 8u https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005931
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-341023

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy