SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-102842"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-102842" > Study of functional...

Study of functional variants of the BANK1 gene in rheumatoid arthritis

Orozco, Gisela (författare)
Abelson, Anna-Karin (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
González-Gay, Miguel A. (författare)
visa fler...
Balsa, Alejandro (författare)
Pascual-Salcedo, Dora (författare)
García, Antonio (författare)
Fernández-Gutierrez, Benjamín (författare)
Petersson, Ingemar (författare)
Lund University,Lunds universitet,Ortopedi, Lund,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Orthopaedics (Lund),Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Pons-Estel, Bernardo (författare)
Eimon, Alicia (författare)
Paira, Sergio (författare)
Scherbarth, Hugo R. (författare)
Alarcón-Riquelme, Marta (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
Martín, Javier (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Wiley, 2009
2009
Engelska.
Ingår i: Arthritis and Rheumatism. - : Wiley. - 0004-3591 .- 1529-0131. ; 60:2, s. 372-379
Relaterad länk:
https://onlinelibrar...
visa fler...
http://dx.doi.org/10...
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • OBJECTIVE: To investigate 1 functional (rs17266594) and 2 potentially functional (rs10516487 and rs3733197) BANK1 variants, which were previously identified as systemic lupus erythematosus (SLE) susceptibility markers, to test whether they are associated with rheumatoid arthritis (RA). METHODS: Four different cohorts were included in the study: 1,080 RA patients and 1,368 healthy controls from Spain, 278 RA patients and 568 healthy controls from Sweden, 288 RA patients and 287 healthy controls from Argentina, and 288 RA patients and 288 healthy controls from Mexico. Samples were genotyped for BANK1 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using a TaqMan 5'-allele discrimination assay. Statistical analysis comparing allele and genotype distributions was performed with the chi-square test. RESULTS: We did not find a significant association between RA and the rs10516487 and rs17266594 BANK1 polymorphisms. However, there was an increase in the major alleles among RA patients. Similarly, for rs3733197, there was an increase in the major allele among patients in every cohort. Nevertheless, this skewing reached statistical significance in the Spanish (P = 0.01, odds ratio [OR] 1.17 [95% confidence interval (95% CI) 1.03-1.32]) and Argentinean (P = 0.04, OR 1.31 [95% CI 1.00-1.72]) populations. We found a significant association of rs10516487 (P = 0.005, OR 1.15 [95% CI 1.04-1.28]) and rs3733197 (P = 0.0009, OR 1.17 [95% CI 1.07-1.29]) with RA in the pooled analysis. In a 3-SNP haplotype analysis, we found that the major TGG haplotype was significantly associated with RA (P = 0.005, OR 1.14 [95% CI 1.04-1.25]). In addition, we found a common CAA haplotype that was protective against RA (P = 0.0004, OR 0.82 [95% CI 0.74-0.92]). CONCLUSION: These results suggest that BANK1 SNPs and haplotypes may contribute to RA susceptibility with a low risk.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy