Surface Plasmon Resonance Biosensor Based Fragment Screening Using Acetylcholine Binding Protein Identifies Ligand Efficiency Hot Spots (LE Hot Spots) by Deconstruction of Nicotinic Acetylcholine Receptor α7 Ligands

The soluble acetylcholine binding protein (AChBP) is a homologue of the ligand-binding domain of the nicotinic acetylcholine receptors (nAChR). To guide future fragment-screening using surface plasmon resonance (SPR) biosensor technology as a label-free, direct binding, biophysical screening assay, a focused fragment library was generated based on deconstruction of a set of α7 nAChR selective quinuclidine containing ligands with nanomolar affinities. The interaction characteristics of the fragments and the parent compounds with AChBP were evaluated using an SPR biosensor assay. The data obtained from this direct binding assay correlated well with data from the reference radioligand displacement assay. Ligand efficiencies for different (structural) groups of fragments in the library were correlated to binding with distinct regions of the binding pocket, thereby identifying ligand efficiency hot spots (LE hot spots). These hot spots can be used to identity the most promising hit fragments in a large scale fragment library screen.

Retra, Kim (författare)
Geitmann, Matthis (författare)
Källblad, Per (författare)
Nahar, Tariq (författare)
van Elk, René (författare)
Smit, August B (författare)
van Muijlwijk-Koezen, Jacqueline E (författare)
Leurs, Rob (författare)
Irth, Hubertus (författare)
Danielson, U. Helena,1959-Uppsala universitet,Biokemi,U Helena Danielson(Swepub:uu)helenads (författare)
de Esch, Iwan J P (författare)
Uppsala universitetBiokemi (creator_code:org_t)

Ingår i:Journal of Medicinal Chemistry: American Chemical Society (ACS)53:19, s. 7192-72010022-26231520-4804

Av författaren/redakt...: de Kloe, Gerdien ...; Retra, Kim; Geitmann, Matthi ...; Källblad, Per; Nahar, Tariq; van Elk, René; visa fler...; Smit, August B; van Muijlwijk-Ko ...; Leurs, Rob; Irth, Hubertus; Danielson, U. He ...; de Esch, Iwan J ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Farmaceutiska ve ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.