SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/336885"
 

Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/336885" > Large-scale plasma ...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00008378naa a2200397 4500
001oai:gup.ub.gu.se/336885
003SwePub
008240528s2024 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://gup.ub.gu.se/publication/3368852 URI
0247 a https://doi.org/10.1093/eurjpc/zwae1242 DOI
040 a (SwePub)gu
041 a eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Royer, Patricku Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xroypa
2451 0a Large-scale plasma proteomics in the UK Biobank modestly improves prediction of major cardiovascular events in a population without previous cardiovascular disease
264 1c 2024
520 a [ ' A i m s I m p r o v e d i d e n t i f i c a t i o n o f i n d i v i d u a l s a t h i g h r i s k o f d e v e l o p i n g c a r d i o v a s c u l a r d i s e a s e w o u l d e n a b l e t a r g e t e d i n t e r v e n t i o n s a n d p o t e n t i a l l y l e a d t o r e d u c t i o n s i n m o r t a l i t y a n d m o r b i d i t y . O u r a i m w a s t o d e t e r m i n e w h e t h e r u s e o f l a r g e - s c a l e p r o t e o m i c s i m p r o v e s p r e d i c t i o n o f c a r d i o v a s c u l a r e v e n t s b e y o n d t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s ( T R F s ) . M e t h o d s a n d r e s u l t s U s i n g p r o x i m i t y e x t e n s i o n a s s a y s , 2 9 1 9 p l a s m a p r o t e i n s w e r e m e a s u r e d i n 3 8 3 8 0 p a r t i c i p a n t s o f t h e U K B i o b a n k . B o t h d a t a - a n d l i t e r a t u r e - b a s e d f e a t u r e s e l e c t i o n a n d t r a i n e d m o d e l s u s i n g e x t r e m e g r a d i e n t b o o s t i n g m a c h i n e l e a r n i n g w e r e u s e d t o p r e d i c t r i s k o f m a j o r c a r d i o v a s c u l a r e v e n t s ( M A C E s : f a t a l a n d n o n - f a t a l m y o c a r d i a l i n f a r c t i o n , s t r o k e , a n d c o r o n a r y a r t e r y r e v a s c u l a r i z a t i o n ) d u r i n g a 1 0 - y e a r f o l l o w - u p . A r e a u n d e r t h e c u r v e ( A U C ) a n d n e t r e c l a s s i f i c a t i o n i n d e x ( N R I ) w e r e u s e d t o e v a l u a t e t h e a d d i t i v e v a l u e o f s e l e c t e d p r o t e i n p a n e l s t o M A C E p r e d i c t i o n b y S y s t e m a t i c C O r o n a r y R i s k E v a l u a t i o n 2 ( S C O R E 2 ) o r t h e 1 0 T R F s u s e d i n S C O R E 2 . S C O R E 2 a n d S C O R E 2 r e f i t t e d t o U K B i o b a n k d a t a p r e d i c t e d M A C E w i t h A U C s o f 0 . 7 4 0 a n d 0 . 7 4 9 , r e s p e c t i v e l y . D a t a - d r i v e n s e l e c t i o n i d e n t i f i e d 1 1 4 p r o t e i n s o f g r e a t e s t r e l e v a n c e f o r p r e d i c t i o n . P r e d i c t i o n o f M A C E w a s n o t i m p r o v e d b y u s i n g t h e s e p r o t e i n s a l o n e ( A U C o f 0 . 7 5 8 ) b u t w a s s i g n i f i c a n t l y i m p r o v e d b y c o m b i n i n g t h e s e p r o t e i n s w i t h S C O R E 2 o r t h e 1 0 T R F s ( A U C = 0 . 7 7 1 , P < 0 0 1 , N R I = 0 . 1 4 0 , a n d A U C = 0 . 7 6 7 , P = 0 . 0 3 , N R I 0 . 0 5 3 , r e s p e c t i v e l y ) . L i t e r a t u r e - b a s e d p r o t e i n s e l e c t i o n ( 1 1 3 p r o t e i n s f r o m f i v e p r e v i o u s s t u d i e s ) a l s o i m p r o v e d r i s k p r e d i c t i o n b e y o n d T R F s w h i l e a r a n d o m s e l e c t i o n o f 1 1 4 p r o t e i n s d i d n o t . C o n c l u s i o n L a r g e - s c a l e p l a s m a p r o t e o m i c s w i t h d a t a - d r i v e n a n d l i t e r a t u r e - b a s e d p r o t e i n s e l e c t i o n m o d e s t l y i m p r o v e s p r e d i c t i o n o f f u t u r e M A C E b e y o n d T R F s . L a y s u m m a r y T h e r i s k o f h a v i n g a m y o c a r d i a l i n f a r c t i o n o r s t r o k e i s u s u a l l y a s s e s s e d b y c l i n i c a l s c o r e s i n c l u d i n g t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s f o r c a r d i o v a s c u l a r d i s e a s e . T h e d e v e l o p m e n t o f n e w t e c h n o l o g i e s e n a b l e s t h e r a p i d m e a s u r e m e n t o f a n i n c r e a s i n g n u m b e r o f b l o o d p r o t e i n s . I n t h i s s t u d y , w e a p p l i e d m a c h i n e l e a r n i n g t e c h n i q u e s i n a U K - b a s e d c o h o r t o f 3 8 3 8 0 p a r t i c i p a n t s w i t h 2 9 1 9 b l o o d p r o t e i n s m e a s u r e d . W e o b t a i n e d a s e t o f 1 1 4 p r o t e i n s t h a t i m p r o v e d t h e p r e d i c t i o n o f t h e 1 0 - y e a r r i s k o f m a j o r c a r d i o v a s c u l a r e v e n t w h e n a d d e d t o t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s . I m p r o v e m e n t s w e r e a l s o a c h i e v e d u s i n g a s e t o f 1 1 3 p r o t e i n s f o u n d i n p r e v i o u s s t u d i e s . H o w e v e r , t h e m a g n i t u d e o f t h e s e i m p r o v e m e n t s w a s r e l a t i v e l y l o w a n d t h e c l i n i c a l u t i l i t y o f c o m b i n i n g t h e s e p r o t e i n s w i t h t r a d i t i o n a l r i s k f a c t o r s i n p r i m a r y p r e v e n t i o n w i l l h a v e t o b e f u r t h e r i n v e s t i g a t e d . ' , ' [ G R A P H I C S ] ' , ' . ' ]
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Kardiologi0 (SwePub)302062 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Cardiac and Cardiovascular Systems0 (SwePub)302062 hsv//eng
653 a Proteomics
653 a Cardiovascular diseases
653 a Risk factors
653 a Machine learning
653 a UK Biobank
7001 a Björnson, Elias,d 1988u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xbelia
7001 a Adiels, Martin,d 1976u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xadima
7001 a Josefson, Rebeccau Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xlinre
7001 a Hagberg, Evau Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xhevaj
7001 a Gummesson, Anders,d 1973u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xguman
7001 a Bergström, Göran,d 1964u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xbgort
7102 a Göteborgs universitetb Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin4 org
7730 t EUROPEAN JOURNAL OF PREVENTIVE CARDIOLOGYx 2047-4873x 2047-4881
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/336885
8564 8u https://doi.org/10.1093/eurjpc/zwae124

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy