SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:8c7e40d1-16a3-4736-b012-fa9ac5daaac6"
 

Sökning: id:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:8c7e40d1-16a3-4736-b012-fa9ac5daaac6" > In Vitro Selection ...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00004950naa a2200553 4500
001oai:lup.lub.lu.se:8c7e40d1-16a3-4736-b012-fa9ac5daaac6
003SwePub
008160401s2014 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://lup.lub.lu.se/record/44314862 URI
0247 a https://doi.org/10.1007/s12033-014-9749-x2 DOI
040 a (SwePub)lu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a art2 swepub-publicationtype
072 7a ref2 swepub-contenttype
1001 a Barfod, Andersu Lund University,Lunds universitet,Biokemi och Strukturbiologi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biochemistry and Structural Biology,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)orgk-aba
2451 0a In Vitro Selection of RNA Aptamers Directed Against Protein E: A Haemophilus influenzae Adhesin. : a Haemophilus influenzae adhesin
264 c 2014-03-29
264 1b Springer Science and Business Media LLC,c 2014
300 a 12 s.
520 a Protein E (PE) of Haemophilus influenzae is a highly conserved ubiquitous surface protein involved in adhesion to and activation of epithelial cells. The host proteins-vitronectin, laminin, and plasminogen are major targets for PE-dependent interactions with the host. To identify novel inhibitory molecules of PE, we used an in vitro selection method based on systematic evolution of ligands by exponential enrichment known as SELEX in order to select 2'F-modified RNA aptamers that specifically bind to PE. Fourteen selection cycles were performed with decreasing concentrations of PE. Sequencing of clones from the 14th selection round revealed the presence of semiconserved sequence motifs in loop regions of the RNA aptamers. Among these, three aptamers showed the highest affinity to PE in electrophoretic mobility shift assays and in dot blots. These three aptamers also inhibited the interaction of PE with vitronectin as revealed by ELISA. Moreover, pre-treatment of H. influenzae with the aptamers significantly inhibited binding of vitronectin to the bacterial surface. Biacore experiments indicated that one of the aptamers had a higher binding affinity for PE as compared to the other aptamers. Our results show that it is possible to select RNA inhibitors against bacterial adhesins using SELEX in order to inhibit interactions with target proteins.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinsk bioteknologix Medicinsk bioteknologi0 (SwePub)304012 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Medical Biotechnologyx Medical Biotechnology0 (SwePub)304012 hsv//eng
653 a Adhesins, Bacterial
653 a Aptamers, Nucleotide
653 a Base Sequence
653 a Biotechnology
653 a DNA, Bacterial
653 a Haemophilus influenzae
653 a Humans
653 a In Vitro Techniques
653 a Molecular Sequence Data
653 a Nucleic Acid Conformation
653 a Protein Binding
653 a SELEX Aptamer Technique
653 a Surface Plasmon Resonance
653 a Vitronectin
653 a Journal Article
653 a Research Support, Non-U.S. Gov't
7001 a Singh, Birendrau Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups4 aut0 (Swepub:lu)med-bas
7001 a Johanson, Urbanu Lund University,Lunds universitet,Biokemi och Strukturbiologi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biochemistry and Structural Biology,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)pbio-ujo
7001 a Riesbeck, Kristianu Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups4 aut0 (Swepub:lu)mikr-kri
7001 a Kjellbom, Peru Lund University,Lunds universitet,Biokemi och Strukturbiologi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biochemistry and Structural Biology,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)pbio-pkj
7102 a Biokemi och Strukturbiologib Centrum för Molekylär Proteinvetenskap4 org
7730 t Molecular Biotechnologyd : Springer Science and Business Media LLCg 56:8, s. 714-725q 56:8<714-725x 1559-0305x 1073-6085
8564 u http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24682699?dopt=Abstracty FULLTEXT
8564 u http://dx.doi.org/10.1007/s12033-014-9749-xx freey FULLTEXT
8564 8u https://lup.lub.lu.se/record/4431486
8564 8u https://doi.org/10.1007/s12033-014-9749-x

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Barfod, Anders
Singh, Birendra
Johanson, Urban
Riesbeck, Kristi ...
Kjellbom, Per
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinsk biotek ...
och Medicinsk biotek ...
Artiklar i publikationen
Molecular Biotec ...
Av lärosätet
Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Wikipedia om författaren:
Anders_Barfod
Barfod, Anders
en

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy