Sökning: id:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:127938221" >
Integrative genomic...
Integrative genomics with mediation analysis in a survival context
-
- Nemes, Szilard, 1977 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Parris, Toshima Z, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Danielsson, Anna, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
visa fler...
-
- Einbeigi, Zakaria, 1962 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Steineck, Gunnar, 1952 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Karolinska Institutet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Miao Jonasson, Junmei, 1972 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
- Helou, Khalil, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Hindawi Limited, 2013
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Computational and mathematical methods in medicine. - : Hindawi Limited. - 1748-6718 .- 1748-670X. ; 2013, s. 413783-
- Relaterad länk:
-
http://downloads.hin...
-
visa fler...
-
http://kipublication...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- DNA copy number aberrations (DCNA) and subsequent altered gene expression profiles may have a major impact on tumor initiation, on development, and eventually on recurrence and cancer-specific mortality. However, most methods employed in integrative genomic analysis of the two biological levels, DNA and RNA, do not consider survival time. In the present note, we propose the adoption of a survival analysis-based framework for the integrative analysis of DCNA and mRNA levels to reveal their implication on patient clinical outcome with the prerequisite that the effect of DCNA on survival is mediated by mRNA levels. The specific aim of the paper is to offer a feasible framework to test the DCNA-mRNA-survival pathway. We provide statistical inference algorithms for mediation based on asymptotic results. Furthermore, we illustrate the applicability of the method in an integrative genomic analysis setting by using a breast cancer data set consisting of 141 invasive breast tumors. In addition, we provide implementation in R.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas