SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:his-23313"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:his-23313" > Regional transcript...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00007667naa a2200709 4500
001oai:DiVA.org:his-23313
003SwePub
008231016s2023 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:gup.ub.gu.se/332156
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:his:diva-233132 URI
0247 a https://doi.org/10.1152/ajpheart.00438.20232 DOI
0247 a https://gup.ub.gu.se/publication/3321562 URI
040 a (SwePub)hisd (SwePub)gu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Sandstedt, Mikael,d 1990u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xsamik
2451 0a Regional transcriptomic profiling reveals immune system enrichment in nonfailing atria as well as all chambers of the failing human heart
264 1b American Physiological Society,c 2023
338 a print2 rdacarrier
500 a This study was funded by grants from the Swedish Society of Medicine, the Gothenburg Society of Medicine, the Heart-Lung Foundation, the Emelle Foundation, the foundations of the Sahlgrenska University Hospital, the University of Skövde, the Swedish Knowledge Foundation, the foundation Research Without Animal Experiments, and the Swedish Royal Academy and by ALF research grants from the Sahlgrenska University Hospital.
520 a The different chambers of the human heart demonstrate regional physiological traits and may be differentially affected during pathologic remodeling, resulting in heart failure. Few previous studies have, however, characterized the different chambers at a transcriptomic level. We therefore conducted whole-tissue RNA sequencing and gene set enrichment analysis of biopsies collected from the four chambers of adult failing (n = 8) and nonfailing (n = 11) human hearts. Atria and ventricles demonstrated distinct transcriptional patterns. Compared to nonfailing ventricles, the transcriptional pattern of nonfailing atria was enriched for a large number of gene sets associated with cardiogenesis, the immune system and bone morphogenetic protein (BMP), transforming growth factor beta (TGF beta), MAPK/JNK and Wnt signaling. Differences between failing and nonfailing hearts were also determined. The transcriptional pattern of failing atria was distinct compared to that of nonfailing atria and enriched for gene sets associated with the innate and adaptive immune system, TGF beta/SMAD signaling, and changes in endothelial, smooth muscle cell and cardiomyocyte physiology. Failing ventricles were also enriched for gene sets associated with the immune system. Based on the transcriptomic patterns, upstream regulators associated with heart failure were identified. These included many immune response factors predicted to be similarly activated for all chambers of failing hearts. In summary, the heart chambers demonstrate distinct transcriptional patterns that differ between failing and nonfailing hearts. Immune system signaling may be a hallmark of all four heart chambers in failing hearts, and could constitute a novel therapeutic target.
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Utvecklingsbiologi0 (SwePub)106142 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Developmental Biology0 (SwePub)106142 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Genetik0 (SwePub)106092 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Genetics0 (SwePub)106092 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Medicinsk genetik0 (SwePub)301072 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Medical Genetics0 (SwePub)301072 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Bioinformatik och systembiologi0 (SwePub)106102 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Bioinformatics and Systems Biology0 (SwePub)106102 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Kardiologi0 (SwePub)302062 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Cardiac and Cardiovascular Systems0 (SwePub)302062 hsv//eng
653 a Heart Failure
653 a Immune system
653 a Normal Heart
653 a Transcriptomics
653 a Upstream Regulators
653 a Bioinformatik
653 a Bioinformatics
653 a heart failure
653 a immune system
653 a normal heart
653 a transcriptomics
653 a upstream regulators
7001 a Vukusic, Kristina,d 1979u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xkajkr
7001 a Johansson, Markusu Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics4 aut0 (Swepub:his)oham
7001 a Jonsson, Marianne,d 1962u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xjmare
7001 a Magnusson, Rasmus,d 1992-u Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics4 aut0 (Swepub:his)magr
7001 a Mattsson Hultén, Lillemor,d 1951u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xmatli
7001 a Dellgren, Göran,d 1961u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xdelgo
7001 a Jeppsson, Anders,d 1960u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xjepan
7001 a Lindahl, Anders,d 1954u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xlandy
7001 a Synnergren, Janeu Gothenburg University,Göteborgs universitet,Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xsynja
7001 a Sandstedt, Joakimu Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine4 aut0 (Swepub:gu)xsjoad
7102 a Göteborgs universitetb Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin4 org
7730 t American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiologyd : American Physiological Societyg 325:6, s. H1430-H1445q 325:6<H1430-H1445x 0363-6135x 1522-1539
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:his:diva-23313
8564 8u https://doi.org/10.1152/ajpheart.00438.2023
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/332156

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy