Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:lnu-51107" >
Molecular dynamics ...
-
Åqvist, JohanUppsala University
(författare)
Molecular dynamics simulations of water and biomolecules wit a Monte Carlo constant pressure algorithm
- Artikel/kapitelEngelska2004
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Elsevier,2004
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:lnu-51107
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:lnu:diva-51107URI
-
https://doi.org/10.1016/j.cplett.2003.12.039DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
A mixed molecular dynamics/Monte Carlo (MD/MC) algorithm for constant pressure simulations of arbitrary molecular systems is examined. Calculations are reported at ambient and high pressures both for liquid water systems and for a chemical reaction step in a solvated enzyme utilizing empirical valence bond potentials. The present method reproduces earlier reported results well and is computationally efficient since it does not require the virial to be evaluated at each MD step. It is also found that the effects of introducing MC volume steps on the dynamics of the system are negligible provided that the volume step sizes and updating frequencies are appropriately chosen.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Wennerström, PetraUppsala University
(författare)
-
Nervall, MartinUppsala University
(författare)
-
Bjelic, SinisaUppsala University(Swepub:lnu)sibjaa
(författare)
-
Brandsdal, Bjørn O.Uppsala University
(författare)
-
Uppsala University
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Chemical Physics Letters: Elsevier384:4-6, s. 288-2940009-26141873-4448
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas