A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:2e9c9c55-e941-4c4d-82af-7bb3ae9251cf" > A chromosome confor...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Mascher, MartinLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research,German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv) (författare)

A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome

Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2017-04-26
Springer Science and Business Media LLC,2017
7 s.

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:2e9c9c55-e941-4c4d-82af-7bb3ae9251cf
https://lup.lub.lu.se/record/2e9c9c55-e941-4c4d-82af-7bb3ae9251cfURI
https://doi.org/10.1038/nature22043DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

Cereal grasses of the Triticeae tribe have been the major food source in temperate regions since the dawn of agriculture. Their large genomes are characterized by a high content of repetitive elements and large pericentromeric regions that are virtually devoid of meiotic recombination. Here we present a high-quality reference genome assembly for barley (Hordeum vulgare L.). We use chromosome conformation capture mapping to derive the linear order of sequences across the pericentromeric space and to investigate the spatial organization of chromatin in the nucleus at megabase resolution. The composition of genes and repetitive elements differs between distal and proximal regions. Gene family analyses reveal lineage-specific duplications of genes involved in the transport of nutrients to developing seeds and the mobilization of carbohydrates in grains. We demonstrate the importance of the barley reference sequence for breeding by inspecting the genomic partitioning of sequence variation in modern elite germplasm, highlighting regions vulnerable to genetic erosion.

Ämnesord och genrebeteckningar

LANTBRUKSVETENSKAPER Bioteknologi med applikationer på växter och djur Genetik och förädling inom lantbruksvetenskap hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Agricultural Biotechnology Genetics and Breeding in Agricultural Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Botanik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Botany hsv//eng
Plant genetics
DNA sequencing
Natural variation in plants
Agricultural genetics
Hordeum vulgare

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Gundlach, HeidrunHelmholtz Zentrum München (författare)
Himmelbach, AxelLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Beier, SebastianLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Twardziok, Sven O.Helmholtz Zentrum München (författare)
Wicker, ThomasUniversity of Zurich (författare)
Radchuk, VolodymyrLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Dockter, ChristophCarlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory (författare)
Hedley, Pete E.Scottish Crop Research Institute (författare)
Russell, JoanneScottish Crop Research Institute (författare)
Bayer, MichaScottish Crop Research Institute (författare)
Ramsay, LukeScottish Crop Research Institute (författare)
Liu, HuiScottish Crop Research Institute (författare)
Haberer, GeorgHelmholtz Zentrum München (författare)
Zhang, Xiao QiMurdoch University (författare)
Zhang, QisenAustralian Export Grains Innovation Centre (författare)
Barrero, Roberto A.Murdoch University (författare)
Li, LinUniversity of Minnesota (författare)
Taudien, StefanLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
Groth, MarcoLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
Felder, MariusLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
Hastie, AlexBioNano Genomics Inc. (författare)
Šimková, HanaCentre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research (författare)
Stanková, HelenaCentre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research (författare)
Vrána, JanCentre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research (författare)
Chan, SakiBioNano Genomics Inc. (författare)
Munõz-Amatriaín, MariáUniversity of California, Riverside (författare)
Ounit, RachidUniversity of California, Riverside (författare)
Wanamaker, SteveUniversity of California, Riverside (författare)
Bolser, DanielEuropean Bioinformatics Institute (författare)
Colmsee, ChristianLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Schmutzer, ThomasLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Aliyeva-Schnorr, LalaLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Grasso, StefanoUniversity of Udine (författare)
Tanskanen, JaakkoUniversity of Helsinki (författare)
Chailyan, AnnaCarlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory (författare)
Sampath, DharanyaEarlham Institute (författare)
Heavens, DarrenEarlham Institute (författare)
Clissold, LeahEarlham Institute (författare)
Cao, SujieGerman Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv) (författare)
Chapman, BrettMurdoch University (författare)
Dai, FeiZhejiang University (författare)
Han, YongZhejiang University (författare)
Li, HuaBeijing Genomics Institute (författare)
Li, XuanBeijing Genomics Institute (författare)
Lin, ChongyunBeijing Genomics Institute (författare)
McCooke, John K.Murdoch University (författare)
Tan, CongMurdoch University (författare)
Wang, PenghaoMurdoch University (författare)
Wang, SongboBeijing Genomics Institute (författare)
Yin, ShuyaZhejiang University (författare)
Zhou, GaofengMurdoch University (författare)
Poland, Jesse A.Kansas State University (författare)
Bellgard, Matthew I.Murdoch University (författare)
Borisjuk, LjudmillaLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Houben, AndreasLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Doleael, JaroslavCentre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research (författare)
Ayling, SarahEarlham Institute (författare)
Lonardi, StefanoUniversity of California, Riverside (författare)
Kersey, PaulEuropean Bioinformatics Institute (författare)
Langridge, PeterUniversity of Adelaide (författare)
Muehlbauer, Gary J.University of Minnesota (författare)
Clark, Matthew D.Earlham Institute,University of East Anglia (författare)
Caccamo, MarioNational Institute of Agricultural Botany,Earlham Institute (författare)
Schulman, Alan H.University of Helsinki (författare)
Mayer, Klaus F. X.Helmholtz Zentrum München,Technical University of Munich (författare)
Platzer, MatthiasLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
Close, Timothy J.University of California, Riverside (författare)
Scholz, UweLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Hansson, MatsLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science(Swepub:lu)biok-mha (författare)
Zhang, GuopingZhejiang University (författare)
Braumann, IlkaCarlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory (författare)
Spannagl, ManuelHelmholtz Zentrum München (författare)
Li, ChengdaoMurdoch University,Yangtze University,Government of Western Australia (författare)
Waugh, RobbieScottish Crop Research Institute,Ninewells Hospital and Medical School (författare)
Stein, NilsUniversity of Western Australia, Crawley,Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant ResearchGerman Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv) (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC544:7651, s. 427-4330028-08361476-4687

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Mascher, Martin; Gundlach, Heidru ...; Himmelbach, Axel; Beier, Sebastian; Twardziok, Sven ...; Wicker, Thomas; visa fler...; Radchuk, Volodym ...; Dockter, Christo ...; Hedley, Pete E.; Russell, Joanne; Bayer, Micha; Ramsay, Luke; Liu, Hui; Haberer, Georg; Zhang, Xiao Qi; Zhang, Qisen; Barrero, Roberto ...; Li, Lin; Taudien, Stefan; Groth, Marco; Felder, Marius; Hastie, Alex; Šimková, Hana; Stanková, Helena; Vrána, Jan; Chan, Saki; Munõz-Amatriaín, ...; Ounit, Rachid; Wanamaker, Steve; Bolser, Daniel; Colmsee, Christi ...; Schmutzer, Thoma ...; Aliyeva-Schnorr, ...; Grasso, Stefano; Tanskanen, Jaakk ...; Chailyan, Anna; Sampath, Dharany ...; Heavens, Darren; Clissold, Leah; Cao, Sujie; Chapman, Brett; Dai, Fei; Han, Yong; Li, Hua; Li, Xuan; Lin, Chongyun; McCooke, John K.; Tan, Cong; Wang, Penghao; Wang, Songbo; Yin, Shuya; Zhou, Gaofeng; Poland, Jesse A.; Bellgard, Matthe ...; Borisjuk, Ljudmi ...; Houben, Andreas; Doleael, Jarosla ...; Ayling, Sarah; Lonardi, Stefano; Kersey, Paul; Langridge, Peter; Muehlbauer, Gary ...; Clark, Matthew D ...; Caccamo, Mario; Schulman, Alan H ...; Mayer, Klaus F. ...; Platzer, Matthia ...; Close, Timothy J ...; Scholz, Uwe; Hansson, Mats; Zhang, Guoping; Braumann, Ilka; Spannagl, Manuel; Li, Chengdao; Waugh, Robbie; Stein, Nils; visa färre...

Om ämnet

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Bioteknologi med ...; och Genetik och förä ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Botanik

Artiklar i publikationen: Nature

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se