Spatial heterogeneity in DNA methylation and chromosomal alterations in diffuse gliomas and meningiomas

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: L773:0893 3952 > (2020-2023) > Spatial heterogenei...

Ferreyra Vega, SandraGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR) (författare)

Spatial heterogeneity in DNA methylation and chromosomal alterations in diffuse gliomas and meningiomas

Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2022

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/317357
https://gup.ub.gu.se/publication/317357URI
https://doi.org/10.1038/s41379-022-01113-8DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Adult-type diffuse gliomas and meningiomas are the most common primary intracranial tumors of the central nervous system. DNA methylation profiling is a novel diagnostic technique increasingly used also in the clinic. Although molecular heterogeneity is well described in these tumors, DNA methylation heterogeneity is less studied. We therefore investigated the intratumor genetic and epigenetic heterogeneity in diffuse gliomas and meningiomas, with focus on potential clinical implications. We further investigated tumor purity as a source for heterogeneity in the tumors. We analyzed genome-wide DNA methylation profiles generated from 126 spatially separated tumor biopsies from 39 diffuse gliomas and meningiomas. Moreover, we evaluated five methods for measurement of tumor purity and investigated intratumor heterogeneity by assessing DNA methylation-based classification, chromosomal copy number alterations and molecular markers. Our results demonstrated homogeneous methylation-based classification of IDH-mutant gliomas and further corroborates subtype heterogeneity in glioblastoma IDH-wildtype and high-grade meningioma patients after excluding samples with low tumor purity. We detected a large number of differentially methylated CpG sites within diffuse gliomas and meningiomas, particularly in tumors of higher grades. The presence of CDKN2A/B homozygous deletion differed in one out of two patients with IDH-mutant astrocytomas, CNS WHO grade 4. We conclude that diffuse gliomas and high-grade meningiomas are characterized by intratumor heterogeneity, which should be considered in clinical diagnostics and in the assessment of methylation-based and molecular markers.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Cell- och molekylärbiologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Cell and Molecular Biology hsv//eng
genomic analysis
glioblastoma
model
idh1
classification
temozolomide
mutations
subgroups
survival
tumors
Pathology

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Wenger, Anna,1990Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xwengt (författare)
Kling, Teresia,1985Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Department of Laboratory Medicine,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR)(Swepub:gu)xdahte (författare)
Bontell, Thomas OlssonGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Physiology(Swepub:gu)xolthx (författare)
Jakola, Asgeir StoreGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience(Swepub:gu)xjakas (författare)
Carén, Helena,1979Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Department of Laboratory Medicine(Swepub:gu)xcareh (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Modern Pathology: Elsevier BV35:11, s. 1551-15610893-3952

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Modern Pathology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Ferreyra Vega, S ...; Wenger, Anna, 19 ...; Kling, Teresia, ...; Bontell, Thomas ...; Jakola, Asgeir S ...; Carén, Helena, 1 ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

Artiklar i publikationen: Modern Pathology

Av lärosätet: Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se