Sökning: WFRF:(Panagiotidis Panagiotis) >
Immunoglobulin heav...
Immunoglobulin heavy variable (IGHV) genes and alleles : new entities, new names and implications for research and prognostication in chronic lymphocytic leukaemia
-
Xochelli, Aliki (författare)
-
Agathangelidis, Andreas (författare)
-
Kavakiotis, Ioannis (författare)
-
visa fler...
-
Minga, Evangelia (författare)
-
- Sutton, Lesley Ann (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Baliakas, Panagiotis (författare)
- Uppsala universitet,Experimentell och klinisk onkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Chouvarda, Ioanna (författare)
-
Giudicelli, Veronique (författare)
-
Vlahavas, Ioannis (författare)
-
Maglaveras, Nikos (författare)
-
Bonello, Lisa (författare)
-
Trentin, Livio (författare)
-
Tedeschi, Alessandra (författare)
-
Panagiotidis, Panagiotis (författare)
-
Geisler, Christian (författare)
-
Langerak, Anton W. (författare)
-
Pospisilova, Sarka (författare)
-
- Jelinek, Diane F. (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Oscier, David (författare)
-
Chiorazzi, Nicholas (författare)
-
Darzentas, Nikos (författare)
-
Davi, Fred (författare)
-
Ghia, Paolo (författare)
-
- Rosenquist, Richard (författare)
- Uppsala universitet,Experimentell och klinisk onkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Hadzidimitriou, Anastasia (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Belessi, Chrysoula (författare)
-
Lefranc, Marie-Paule (författare)
-
- Stamatopoulos, Kostas (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014-11-12
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Immunogenetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0093-7711 .- 1432-1211. ; 67:1, s. 61-66
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Ieext generation sequencing studies in Homo sapiens have identified novel immunoglobulin heavy variable (IGHV) genes and alleles necessitating changes in the international ImMunoGeneTics information system (IMGT) GENE-DB and reference directories of IMGT/V-QUEST. In chronic lymphocytic leukaemia (CLL), the somatic hypermutation (SHM) status of the clonotypic rearranged IGHV gene is strongly associated with patient outcome. Correct determination of this parameter strictly depends on the comparison of the nucleotide sequence of the clonotypic rearranged IGHV gene with that of the closest germline counterpart. Consequently, changes in the reference directories could, in principle, affect the correct interpretation of the IGHV mutational status in CLL. To this end, we analyzed 8066 productive IG heavy chain (IGH) rearrangement sequences from our consortium both before and after the latest update of the IMGT/V-QUEST reference directory. Differences were identified in 405 cases (5 % of the cohort). In 291/405 sequences (71.9 %), changes concerned only the IGHV gene or allele name, whereas a change in the percent germline identity (%GI) was noted in 114/405 (28.1 %) sequences; in 50/114 (43.8 %) sequences, changes in the %GI led to a change in the mutational set. In conclusion, recent changes in the IMGT reference directories affected the interpretation of SHM in a sizeable number of IGH rearrangement sequences from CLL patients. This indicates that both physicians and researchers should consider a re-evaluation of IG sequence data, especially for those IGH rearrangement sequences that, up to date, have a GI close to 98 %, where caution is warranted.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)
Nyckelord
- CLL
- SHM
- New IGHV genes
- New IGHV gene alleles
- Prognostication
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Xochelli, Aliki
-
Agathangelidis, ...
-
Kavakiotis, Ioan ...
-
Minga, Evangelia
-
Sutton, Lesley A ...
-
Baliakas, Panagi ...
-
visa fler...
-
Chouvarda, Ioann ...
-
Giudicelli, Vero ...
-
Vlahavas, Ioanni ...
-
Maglaveras, Niko ...
-
Bonello, Lisa
-
Trentin, Livio
-
Tedeschi, Alessa ...
-
Panagiotidis, Pa ...
-
Geisler, Christi ...
-
Langerak, Anton ...
-
Pospisilova, Sar ...
-
Jelinek, Diane F ...
-
Oscier, David
-
Chiorazzi, Nicho ...
-
Darzentas, Nikos
-
Davi, Fred
-
Ghia, Paolo
-
Rosenquist, Rich ...
-
Hadzidimitriou, ...
-
Belessi, Chrysou ...
-
Lefranc, Marie-P ...
-
Stamatopoulos, K ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Immunologi inom ...
- Artiklar i publikationen
-
Immunogenetics
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet