Sökning: WFRF:(Chan Saki)
> (2017) >
A chromosome confor...
A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome
-
- Mascher, Martin (författare)
- German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv),Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Gundlach, Heidrun (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Himmelbach, Axel (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
visa fler...
-
- Beier, Sebastian (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Twardziok, Sven O. (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Wicker, Thomas (författare)
- University of Zurich
-
- Radchuk, Volodymyr (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Dockter, Christoph (författare)
- Carlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory
-
- Hedley, Pete E. (författare)
- Scottish Crop Research Institute
-
- Russell, Joanne (författare)
- Scottish Crop Research Institute
-
- Bayer, Micha (författare)
- Scottish Crop Research Institute
-
- Ramsay, Luke (författare)
- Scottish Crop Research Institute
-
- Liu, Hui (författare)
- Scottish Crop Research Institute
-
- Haberer, Georg (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Zhang, Xiao Qi (författare)
- Murdoch University
-
- Zhang, Qisen (författare)
- Australian Export Grains Innovation Centre
-
- Barrero, Roberto A. (författare)
- Murdoch University
-
- Li, Lin (författare)
- University of Minnesota
-
- Taudien, Stefan (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Groth, Marco (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Felder, Marius (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Hastie, Alex (författare)
- BioNano Genomics Inc.
-
- Šimková, Hana (författare)
- Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research
-
- Stanková, Helena (författare)
- Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research
-
- Vrána, Jan (författare)
- Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research
-
- Chan, Saki (författare)
- BioNano Genomics Inc.
-
- Munõz-Amatriaín, Mariá (författare)
- University of California, Riverside
-
- Ounit, Rachid (författare)
- University of California, Riverside
-
- Wanamaker, Steve (författare)
- University of California, Riverside
-
- Bolser, Daniel (författare)
- European Bioinformatics Institute
-
- Colmsee, Christian (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Schmutzer, Thomas (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Aliyeva-Schnorr, Lala (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Grasso, Stefano (författare)
- University of Udine
-
- Tanskanen, Jaakko (författare)
- University of Helsinki
-
- Chailyan, Anna (författare)
- Carlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory
-
- Sampath, Dharanya (författare)
- Earlham Institute
-
- Heavens, Darren (författare)
- Earlham Institute
-
- Clissold, Leah (författare)
- Earlham Institute
-
- Cao, Sujie (författare)
- German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv)
-
- Chapman, Brett (författare)
- Murdoch University
-
- Dai, Fei (författare)
- Zhejiang University
-
- Han, Yong (författare)
- Zhejiang University
-
- Li, Hua (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Li, Xuan (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Lin, Chongyun (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- McCooke, John K. (författare)
- Murdoch University
-
- Tan, Cong (författare)
- Murdoch University
-
- Wang, Penghao (författare)
- Murdoch University
-
- Wang, Songbo (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Yin, Shuya (författare)
- Zhejiang University
-
- Zhou, Gaofeng (författare)
- Murdoch University
-
- Poland, Jesse A. (författare)
- Kansas State University
-
- Bellgard, Matthew I. (författare)
- Murdoch University
-
- Borisjuk, Ljudmilla (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Houben, Andreas (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Doleael, Jaroslav (författare)
- Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research
-
- Ayling, Sarah (författare)
- Earlham Institute
-
- Lonardi, Stefano (författare)
- University of California, Riverside
-
- Kersey, Paul (författare)
- European Bioinformatics Institute
-
- Langridge, Peter (författare)
- University of Adelaide
-
- Muehlbauer, Gary J. (författare)
- University of Minnesota
-
- Clark, Matthew D. (författare)
- Earlham Institute,University of East Anglia
-
- Caccamo, Mario (författare)
- Earlham Institute,National Institute of Agricultural Botany
-
- Schulman, Alan H. (författare)
- University of Helsinki
-
- Mayer, Klaus F. X. (författare)
- Technical University of Munich,Helmholtz Zentrum München
-
- Platzer, Matthias (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Close, Timothy J. (författare)
- University of California, Riverside
-
- Scholz, Uwe (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Hansson, Mats (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
-
- Zhang, Guoping (författare)
- Zhejiang University
-
- Braumann, Ilka (författare)
- Carlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory
-
- Spannagl, Manuel (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Li, Chengdao (författare)
- Government of Western Australia,Yangtze University,Murdoch University
-
- Waugh, Robbie (författare)
- Ninewells Hospital and Medical School,Scottish Crop Research Institute
-
- Stein, Nils (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research,University of Western Australia, Crawley
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-04-26
- 2017
- Engelska 7 s.
-
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 544:7651, s. 427-433
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Cereal grasses of the Triticeae tribe have been the major food source in temperate regions since the dawn of agriculture. Their large genomes are characterized by a high content of repetitive elements and large pericentromeric regions that are virtually devoid of meiotic recombination. Here we present a high-quality reference genome assembly for barley (Hordeum vulgare L.). We use chromosome conformation capture mapping to derive the linear order of sequences across the pericentromeric space and to investigate the spatial organization of chromatin in the nucleus at megabase resolution. The composition of genes and repetitive elements differs between distal and proximal regions. Gene family analyses reveal lineage-specific duplications of genes involved in the transport of nutrients to developing seeds and the mobilization of carbohydrates in grains. We demonstrate the importance of the barley reference sequence for breeding by inspecting the genomic partitioning of sequence variation in modern elite germplasm, highlighting regions vulnerable to genetic erosion.
Ämnesord
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Bioteknologi med applikationer på växter och djur -- Genetik och förädling inom lantbruksvetenskap (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Agricultural Biotechnology -- Genetics and Breeding in Agricultural Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
Nyckelord
- Plant genetics
- DNA sequencing
- Natural variation in plants
- Agricultural genetics
- Hordeum vulgare
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Nature
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Mascher, Martin
-
Gundlach, Heidru ...
-
Himmelbach, Axel
-
Beier, Sebastian
-
Twardziok, Sven ...
-
Wicker, Thomas
-
visa fler...
-
Radchuk, Volodym ...
-
Dockter, Christo ...
-
Hedley, Pete E.
-
Russell, Joanne
-
Bayer, Micha
-
Ramsay, Luke
-
Liu, Hui
-
Haberer, Georg
-
Zhang, Xiao Qi
-
Zhang, Qisen
-
Barrero, Roberto ...
-
Li, Lin
-
Taudien, Stefan
-
Groth, Marco
-
Felder, Marius
-
Hastie, Alex
-
Šimková, Hana
-
Stanková, Helena
-
Vrána, Jan
-
Chan, Saki
-
Munõz-Amatriaín, ...
-
Ounit, Rachid
-
Wanamaker, Steve
-
Bolser, Daniel
-
Colmsee, Christi ...
-
Schmutzer, Thoma ...
-
Aliyeva-Schnorr, ...
-
Grasso, Stefano
-
Tanskanen, Jaakk ...
-
Chailyan, Anna
-
Sampath, Dharany ...
-
Heavens, Darren
-
Clissold, Leah
-
Cao, Sujie
-
Chapman, Brett
-
Dai, Fei
-
Han, Yong
-
Li, Hua
-
Li, Xuan
-
Lin, Chongyun
-
McCooke, John K.
-
Tan, Cong
-
Wang, Penghao
-
Wang, Songbo
-
Yin, Shuya
-
Zhou, Gaofeng
-
Poland, Jesse A.
-
Bellgard, Matthe ...
-
Borisjuk, Ljudmi ...
-
Houben, Andreas
-
Doleael, Jarosla ...
-
Ayling, Sarah
-
Lonardi, Stefano
-
Kersey, Paul
-
Langridge, Peter
-
Muehlbauer, Gary ...
-
Clark, Matthew D ...
-
Caccamo, Mario
-
Schulman, Alan H ...
-
Mayer, Klaus F. ...
-
Platzer, Matthia ...
-
Close, Timothy J ...
-
Scholz, Uwe
-
Hansson, Mats
-
Zhang, Guoping
-
Braumann, Ilka
-
Spannagl, Manuel
-
Li, Chengdao
-
Waugh, Robbie
-
Stein, Nils
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Bioteknologi med ...
-
och Genetik och förä ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Botanik
- Artiklar i publikationen
-
Nature
- Av lärosätet
-
Lunds universitet