SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Jussila Jari)
 

Sökning: WFRF:(Jussila Jari) > A molecular-based i...

A molecular-based identification resource for the arthropods of Finland

Roslin, Tomas (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för ekologi,Department of Ecology,University of Helsinki
Somervuo, Panu (författare)
Pentinsaari, Mikko (författare)
visa fler...
Hebert, Paul D. N. (författare)
Agda, Jireh (författare)
Ahlroth, Petri (författare)
Anttonen, Perttu (författare)
Aspi, Jouni (författare)
Blagoev, Gergin (författare)
Blanco, Santiago (författare)
Chan, Dean (författare)
Clayhills, Tom (författare)
deWaard, Jeremy (författare)
deWaard, Stephanie (författare)
Elliot, Tyler (författare)
Elo, Riikka (författare)
Haapala, Sami (författare)
Helve, Eero (författare)
Ilmonen, Jari (författare)
Hirvonen, Petri (författare)
Ho, Chris (författare)
Itämies, Juhani (författare)
Ivanov, Vladislav (författare)
Jakovlev, Jevgeni (författare)
Juslén, Aino (författare)
Jussila, Reijo (författare)
Kahanpää, Jere (författare)
Kaila, Lauri (författare)
Kaitila, Jari-Pekka (författare)
Kakko, Ari (författare)
Kakko, Iiro (författare)
Karhu, Ali (författare)
Karjalainen, Sami (författare)
Kjaerandsen, Jostein (författare)
Koskinen, Janne (författare)
Laasonen, Erkki M. (författare)
Laasonen, Leena (författare)
Laine, Erkka (författare)
Lampila, Petri (författare)
Levesque-Beaudin, Valerie (författare)
Lu, Liuqiong (författare)
Lähteenaro, Meri (författare)
Stockholms universitet,Avdelningen för zoologisk systematik och evolutionsforskning,Swedish Museum of Natural History, Sweden
Majuri, Pekka (författare)
Malmberg, Sampsa (författare)
Manjunath, Ramya (författare)
Martikainen, Petri (författare)
Mattila, Jaakko (författare)
McKeown, Jaclyn (författare)
Metsälä, Petri (författare)
Miklasevskaja, Margarita (författare)
Miller, Meredith (författare)
Miskie, Renee (författare)
Muinonen, Arto (författare)
Mukkala, Veli-Matti (författare)
Naik, Suresh (författare)
Nikolova, Nadia (författare)
Nupponen, Kari (författare)
Ovaskainen, Otso (författare)
Österblad, Ika (författare)
Paasivirta, Lauri (författare)
Pajunen, Timo (författare)
Parkko, Petri (författare)
Paukkunen, Juho (författare)
Penttinen, Ritva (författare)
Perez, Kate (författare)
Pohjoismäki, Jaakko (författare)
Prosser, Sean (författare)
Raekunnas, Martti (författare)
Rahulan, Miduna (författare)
Rannisto, Meeri (författare)
Ratnasingham, Sujeevan (författare)
Raukko, Pekka (författare)
Rinne, Aki (författare)
Rintala, Teemu (författare)
Miranda Romo, Susana (författare)
Salmela, Jukka (författare)
Salokannel, Juha (författare)
Savolainen, Riitta (författare)
Schulman, Leif (författare)
Sihvonen, Pasi (författare)
Soliman, Dina (författare)
Sones, Jayme (författare)
Steinke, Claudia (författare)
Ståhls, Gunilla (författare)
Tabell, Jukka (författare)
Tiusanen, Mikko (författare)
Várkonyi, Gergely (författare)
Vesterinen, Eero J. (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för ekologi,Department of Ecology,University of Turku
Viitanen, Esko (författare)
Vikberg, Veli (författare)
Viitasaari, Matti (författare)
Vilen, Jussi (författare)
Warne, Connor (författare)
Wei, Catherine (författare)
Winqvist, Kaj (författare)
Zakharov, Evgeny (författare)
Mutanen, Marko (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2021-11-03
2022
Engelska.
Ingår i: Molecular Ecology Resources. - : Wiley. - 1755-098X .- 1755-0998. ; 22:2, s. 803-822
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • To associate specimens identified by molecular characters to other biological knowledge, we need reference sequences annotated by Linnaean taxonomy. In this study, we (1) report the creation of a comprehensive reference library of DNA barcodes for the arthropods of an entire country (Finland), (2) publish this library, and (3) deliver a new identification tool for insects and spiders, as based on this resource. The reference library contains mtDNA COI barcodes for 11,275 (43%) of 26,437 arthropod species known from Finland, including 10,811 (45%) of 23,956 insect species. To quantify the improvement in identification accuracy enabled by the current reference library, we ran 1000 Finnish insect and spider species through the Barcode of Life Data system (BOLD) identification engine. Of these, 91% were correctly assigned to a unique species when compared to the new reference library alone, 85% were correctly identified when compared to BOLD with the new material included, and 75% with the new material excluded. To capitalize on this resource, we used the new reference material to train a probabilistic taxonomic assignment tool, FinPROTAX, scoring high success. For the full-length barcode region, the accuracy of taxonomic assignments at the level of classes, orders, families, subfamilies, tribes, genera, and species reached 99.9%, 99.9%, 99.8%, 99.7%, 99.4%, 96.8%, and 88.5%, respectively. The FinBOL arthropod reference library and FinPROTAX are available through the Finnish Biodiversity Information Facility (www.laji.fi) at https://laji.fi/en/theme/protax. Overall, the FinBOL investment represents a massive capacity-transfer from the taxonomic community of Finland to all sectors of society. 

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biologisk systematik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biological Systematics (hsv//eng)

Nyckelord

COI
DNA barcodes
probabilistic taxonomic assignment
PROTAX
reference library
species identification

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Roslin, Tomas
Somervuo, Panu
Pentinsaari, Mik ...
Hebert, Paul D. ...
Agda, Jireh
Ahlroth, Petri
visa fler...
Anttonen, Perttu
Aspi, Jouni
Blagoev, Gergin
Blanco, Santiago
Chan, Dean
Clayhills, Tom
deWaard, Jeremy
deWaard, Stephan ...
Elliot, Tyler
Elo, Riikka
Haapala, Sami
Helve, Eero
Ilmonen, Jari
Hirvonen, Petri
Ho, Chris
Itämies, Juhani
Ivanov, Vladisla ...
Jakovlev, Jevgen ...
Juslén, Aino
Jussila, Reijo
Kahanpää, Jere
Kaila, Lauri
Kaitila, Jari-Pe ...
Kakko, Ari
Kakko, Iiro
Karhu, Ali
Karjalainen, Sam ...
Kjaerandsen, Jos ...
Koskinen, Janne
Laasonen, Erkki ...
Laasonen, Leena
Laine, Erkka
Lampila, Petri
Levesque-Beaudin ...
Lu, Liuqiong
Lähteenaro, Meri
Majuri, Pekka
Malmberg, Sampsa
Manjunath, Ramya
Martikainen, Pet ...
Mattila, Jaakko
McKeown, Jaclyn
Metsälä, Petri
Miklasevskaja, M ...
Miller, Meredith
Miskie, Renee
Muinonen, Arto
Mukkala, Veli-Ma ...
Naik, Suresh
Nikolova, Nadia
Nupponen, Kari
Ovaskainen, Otso
Österblad, Ika
Paasivirta, Laur ...
Pajunen, Timo
Parkko, Petri
Paukkunen, Juho
Penttinen, Ritva
Perez, Kate
Pohjoismäki, Jaa ...
Prosser, Sean
Raekunnas, Martt ...
Rahulan, Miduna
Rannisto, Meeri
Ratnasingham, Su ...
Raukko, Pekka
Rinne, Aki
Rintala, Teemu
Miranda Romo, Su ...
Salmela, Jukka
Salokannel, Juha
Savolainen, Riit ...
Schulman, Leif
Sihvonen, Pasi
Soliman, Dina
Sones, Jayme
Steinke, Claudia
Ståhls, Gunilla
Tabell, Jukka
Tiusanen, Mikko
Várkonyi, Gergel ...
Vesterinen, Eero ...
Viitanen, Esko
Vikberg, Veli
Viitasaari, Matt ...
Vilen, Jussi
Warne, Connor
Wei, Catherine
Winqvist, Kaj
Zakharov, Evgeny
Mutanen, Marko
visa färre...
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Biologisk system ...
Artiklar i publikationen
Molecular Ecolog ...
Av lärosätet
Stockholms universitet
Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy