Q6: A comprehensive toolkit for empirical valence bond and related free energy calculations

Q6 : A comprehensive toolkit for empirical valence bond and related free energy calculations

Barrozo, Alexandre (författare): Department of Chemistry, University of Southern California, SGM 418, 3620 McClintock Ave., Los Angeles, CA 90089-1062, United StatesDepartment of Chemistry, University of Southern California, SGM 418, 3620 McClintock Ave., Los Angeles, CA 90089-1062, United States

Amrein, Beat Anton (författare): Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi

Esguerra, Mauricio (författare): Uppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik

Wilson, Philippe Barrie (författare): Leicester School of Pharmacy, De Montfort University, The Gateway, Leicester LE1 9BH, UK

Major, Dan Thomas (författare): Department of Chemistry, Bar-Ilan University, Ramat-Gan 52900, Israel

Åqvist, Johan (författare): Uppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik

Kamerlin, Shina C. Lynn, 1981- (författare): Uppsala universitet,Strukturbiologi

(creator_code:org_t)

Relaterad länk:: https://doi.org/10.1...; visa fler...; https://uu.diva-port... (primary) (Raw object); https://doi.org/10.1...; https://urn.kb.se/re...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Abstract Ämnesord

Stäng

Atomistic simulations have become one of the main approaches to study the chemistry and dynamicsof biomolecular systems in solution. Chemical modelling is a powerful way to understand biochemistry,with a number of different programs available to perform specialized calculations. We present here Q6, anew version of the Q software package, which is a generalized package for empirical valence bond, linearinteraction energy, and other free energy calculations. In addition to general technical improvements, Q6extends the reach of the EVB implementation to fast approximations of quantum effects, extended solventdescriptions and quick estimation of the contributions of individual residues to changes in the activationfree energy of reactions.

Av författaren/redakt...: Bauer, Paul; Barrozo, Alexand ...; Purg, Miha; Amrein, Beat Ant ...; Esguerra, Mauric ...; Wilson, Philippe ...; visa fler...; Major, Dan Thoma ...; Åqvist, Johan; Kamerlin, Shina ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Programvarutekni ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.