Genetic diversity of genotype D3 in acute hepatitis B

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Söderström Ann 1961) > Genetic diversity o...

Alestig, Erik,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine (författare)

Genetic diversity of genotype D3 in acute hepatitis B

Artikel/kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2013-04-17
Wiley,2013

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/179344
https://gup.ub.gu.se/publication/179344URI
https://doi.org/10.1002/jmv.23580DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Acute hepatitis B related to injection drug use is often caused by HBV-D3, a subgenotype that probably was introduced in Western Europe in the 1960s. The aim of this study was to describe genetic change over time in injection drug use-related HBV-D3 in one geographic area. Fourteen complete genomes and partial genomic regions of 17 HBV strains of subgenotype D3 causing acute (n=30) or chronic (n=1) hepatitis B at different time points between 1975 and 2009 were investigated. The 14 complete genomes clustered in phylogenetic trees on a sub-branch of HBV-D3 along with a few published sequences with high bootstrap values. In contrast, the phylogenetic tree topology based on nucleotides coding for surface antigen or core was uncertain with bootstrap values below 70% or lower. Variation of nucleotides coding for amino acids 125, 136, and 143 in the a determinant of HBsAg was however linked to complete genome phylogeny, indicating that these codons might be useful as markers for clades. The results show that knowledge about circulating strains is critical for the interpretation of molecular epidemiology investigations. The low degree of genetic change over time of HBV-D3 in the studied groups suggests that outbreaks of acute hepatitis B in injection drug users might originate from a limited number of individuals with chronic infection. Classification based on core or S region phylogeny obtained poor support from bootstrap values, but the presence of clade-specific amino acid substitutions suggests that the S region may be useful for subgenomic molecular epidemiology of HBV.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Infektionsmedicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Infectious Medicine hsv//eng
hepatitis B virus
phylogeny
molecular epidemiology
injection drug use
molecular epidemiology
virus transmission
drug-users
infection
outbreak
subtypes
denmark
region
chains
sweden

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Söderström, Ann,1961 (författare)
Norkrans, Gunnar,1944Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine(Swepub:gu)xnorgu (författare)
Lindh, Magnus,1960Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine(Swepub:gu)xlmagr (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Medical Virology: Wiley85:7, s. 1148-11540146-6615

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Journal of Medical Virology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Alestig, Erik, 1 ...; Söderström, Ann, ...; Norkrans, Gunnar ...; Lindh, Magnus, 1 ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Infektionsmedici ...

Artiklar i publikationen: Journal of Medic ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se