SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Salmen S)
 

Sökning: WFRF:(Salmen S) > (2015-2019) > Spatially resolved ...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00007030naa a2200793 4500
001oai:DiVA.org:su-146004
003SwePub
008170825s2017 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:DiVA.org:umu-138048
009oai:DiVA.org:kth-209734
009oai:DiVA.org:uu-331942
009oai:prod.swepub.kib.ki.se:136276060
009oai:slubar.slu.se:85288
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-1460042 URI
0247 a https://doi.org/10.1038/nplants.2017.612 DOI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-1380482 URI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-2097342 URI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-3319422 URI
0247 a http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:1362760602 URI
0247 a https://res.slu.se/id/publ/852882 URI
040 a (SwePub)sud (SwePub)umud (SwePub)kthd (SwePub)uud (SwePub)kid (SwePub)slu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Giacomello, Stefaniau KTH,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stockholm University, Sweden,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Gene Technol, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden.;Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden.4 aut0 (Swepub:kth)u1j2tb2i
2451 0a Spatially resolved transcriptome profiling in model plant species
264 c 2017-05-08
264 1b Springer Science and Business Media LLC,c 2017
338 a print2 rdacarrier
500 a QC 20170622
520 a Understanding complex biological systems requires functional characterization of specialized tissue domains. However, existing strategies for generating and analysing high-throughput spatial expression profiles were developed for a limited range of organisms, primarily mammals. Here we present the first available approach to generate and study highresolution, spatially resolved functional profiles in a broad range of model plant systems. Our process includes highthroughput spatial transcriptome profiling followed by spatial gene and pathway analyses. We first demonstrate the feasibility of the technique by generating spatial transcriptome profiles from model angiosperms and gymnosperms microsections. In Arabidopsis thaliana we use the spatial data to identify differences in expression levels of 141 genes and 189 pathways in eight inflorescence tissue domains. Our combined approach of spatial transcriptomics and functional profiling offers a powerful new strategy that can be applied to a broad range of plant species, and is an approach that will be pivotal to answering fundamental questions in developmental and evolutionary biology.
650 7a NATURVETENSKAPx Biologi0 (SwePub)1062 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciences0 (SwePub)1062 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Bioinformatik och systembiologi0 (SwePub)106102 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Bioinformatics and Systems Biology0 (SwePub)106102 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Genetik0 (SwePub)106092 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Genetics0 (SwePub)106092 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Utvecklingsbiologi0 (SwePub)106142 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Developmental Biology0 (SwePub)106142 hsv//eng
653 a Bioinformatics
653 a Gene expression profiling
653 a Plant development
653 a RNA sequencing
7001 a Salmén, Fredriku KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:kth)u1bw72vj
7001 a Terebieniec, Barbara K.,d 1983-u Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.4 aut0 (Swepub:umu)bate0003
7001 a Vickovic, Sanjau KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:kth)u10kfosu
7001 a Fernandez Navarro, Joséu Karolinska Inst, Dept Cell & Mol Biol, S-17165 Solna, Sweden.4 aut
7001 a Alexeyenko, Andreyu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Reimegård, Johanu Uppsala universitet,Molekylär evolution,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:uu)jorei499
7001 a McKee, Lauren S.u KTH,Glykovetenskap,KTH Royal Inst Technol, AlbaNova Univ Ctr, Sch Biotechnol, Div Glycosci, S-11421 Stockholm, Sweden.4 aut0 (Swepub:kth)u1nbm728
7001 a Mannapperuma, Chanakau Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.4 aut0 (Swepub:umu)mach0027
7001 a Bulone, Vincentu KTH,Glykovetenskap,University of Adelaide, Australia,KTH Royal Inst Technol, AlbaNova Univ Ctr, Sch Biotechnol, Div Glycosci, S-11421 Stockholm, Sweden.;Univ Adelaide, ARC Ctr Excellence Plant & Cell Walls, Waite Campus, Adelaide, SA 5064, Australia.;Univ Adelaide, Sch Agr Food & Wine, Waite Campus, Adelaide, SA 5064, Australia.4 aut0 (Swepub:kth)u13o1auq
7001 a Ståhl, Patrik L.u Karolinska Inst, Dept Cell & Mol Biol, S-17165 Solna, Sweden.4 aut
7001 a Sundström, Jensu Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology4 aut0 (Swepub:slu)46728
7001 a Street, Nathaniel,d 1979-u Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.4 aut0 (Swepub:umu)rona0006
7001 a Lundeberg, Joakimu KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Gene Technol, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden.4 aut0 (Swepub:kth)u1qkn9kw
7102 a Stockholms universitetb Institutionen för biokemi och biofysik4 org
7102 a Sveriges lantbruksuniversitet
7730 t Nature Plantsd : Springer Science and Business Media LLCg 3:6q 3:6x 2055-026Xx 2055-0278
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-146004
8564 8u https://doi.org/10.1038/nplants.2017.61
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-138048
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-209734
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-331942
8564 8u http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:136276060
8564 8u https://res.slu.se/id/publ/85288

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy