Sökning: WFRF:(Thodberg Malte)
> (2021) >
Genome-wide associa...
Genome-wide association study on 13,167 individuals identifies regulators of hematopoietic stem and progenitor cell levels in human blood
-
- Lopez de Lapuente Portilla, Aitzkoa (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Ekdahl, Ludvig (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Cafaro, Caterina (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
visa fler...
-
- Ali, Zain (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Miharada, Natsumi (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Thorleifsson, Gudmar (författare)
- deCODE Genetics
-
- Zemaitis, Kristijonas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research
-
- Lamarca Arrizabalaga, Antton (författare)
- Lund University
-
- Thodberg, Malte (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Pertesi, Maroulio (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Dhapola, Parashar (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylär hematologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cells and Leukemia,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Hematology (DMH),Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Bao, Erik L (författare)
- Harvard Medical School,Broad Institute
-
- Niroula, Abhishek (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Broad Institute
-
- Bali, Divya (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Norddahl, Gudmundur L. (författare)
- deCODE Genetics
-
- Ugidos Damboriena, Nerea (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Sankaran, Vijay G (författare)
- Broad Institute,Boston Children's Hospital
-
- Karlsson, Göran (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylär hematologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cells and Leukemia,Forskargrupper vid Lunds universitet,Division of Molecular Hematology (DMH),Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups
-
- Thorsteinsdottir, Unnur (författare)
- deCODE Genetics
-
- Larsson, Jonas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,WCMM- Wallenberg center för molekylär medicinsk forskning,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,WCMM-Wallenberg Centre for Molecular Medicine,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Stefánsson, Kári (författare)
- deCODE Genetics
-
- Nilsson, Björn (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för hematologi och transfusionsmedicin,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Hematogenomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Division of Hematology and Transfusion Medicine,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Cold Spring Harbor Laboratory, 2021
- Engelska.
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.biorxiv....
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Understanding how hematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) are regulated is of central importance for the development of new therapies for blood disorders and stem cell transplantation. To date, HSPC regulation has been extensively studied in vitro and in animal models, but less is known about the mechanisms in vivo in humans. Here, in a genome-wide association study on 13,167 individuals, we identify 9 significant and 2 suggestive DNA sequence variants that influence HSPC (CD34+) levels in human blood. The identified loci associate with blood disorders, harbor known and novel HSPC genes, and affect gene expression in HSPCs. Interestingly, our strongest association maps to the PPM1H gene, encoding an evolutionarily conserved serine/threonine phosphatase never previously implicated in stem cell biology. PPM1H is expressed in HSPCs, and the allele that confers higher blood CD34+ cell levels downregulates PPM1H. By functional fine-mapping, we find that this downregulation is caused by the variant rs772557-A, which abrogates a MYB transcription factor binding site in PPM1H intron 1 that is active in specific HSPC subpopulations, including hematopoietic stem cells, and interacts with the promoter by chromatin looping. Furthermore, rs772557-A selectively increases HSPC subpopulations in which the MYB site is active, and PPM1H shRNA- knockdown increased CD34+ and CD34+90+ cell proportions in umbilical cord blood cultures. Our findings represent the first large-scale association study on a stem cell trait, illuminating HSPC regulation in vivo in humans, and identifying PPM1H as a novel inhibition target that can potentially be utilized clinically to facilitate stem cell harvesting for transplantation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Hematologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Hematology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ovr (ämneskategori)
- vet (ämneskategori)
- Av författaren/redakt...
-
Lopez de Lapuent ...
-
Ekdahl, Ludvig
-
Cafaro, Caterina
-
Ali, Zain
-
Miharada, Natsum ...
-
Thorleifsson, Gu ...
-
visa fler...
-
Zemaitis, Kristi ...
-
Lamarca Arrizaba ...
-
Thodberg, Malte
-
Pertesi, Marouli ...
-
Dhapola, Parasha ...
-
Bao, Erik L
-
Niroula, Abhishe ...
-
Bali, Divya
-
Norddahl, Gudmun ...
-
Ugidos Damborien ...
-
Sankaran, Vijay ...
-
Karlsson, Göran
-
Thorsteinsdottir ...
-
Larsson, Jonas
-
Stefánsson, Kári
-
Nilsson, Björn
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Hematologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet