SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Cooper Adam)
 

Sökning: WFRF:(Cooper Adam) > (2020) > The landscape of vi...

  • Zapatka, MarcGerman Cancer Research Centre (författare)

The landscape of viral associations in human cancers

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-02-05
  • Springer Science and Business Media LLC,2020

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:1707e5e8-3681-4994-ab58-bc512e1738af
  • https://lup.lub.lu.se/record/1707e5e8-3681-4994-ab58-bc512e1738afURI
  • https://doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:142904541URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Here, as part of the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, for which whole-genome and-for a subset-whole-transcriptome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumor types was aggregated, we systematically investigated potential viral pathogens using a consensus approach that integrated three independent pipelines. Viruses were detected in 382 genome and 68 transcriptome datasets. We found a high prevalence of known tumor-associated viruses such as Epstein-Barr virus (EBV), hepatitis B virus (HBV) and human papilloma virus (HPV; for example, HPV16 or HPV18). The study revealed significant exclusivity of HPV and driver mutations in head-and-neck cancer and the association of HPV with APOBEC mutational signatures, which suggests that impaired antiviral defense is a driving force in cervical, bladder and head-and-neck carcinoma. For HBV, HPV16, HPV18 and adeno-associated virus-2 (AAV2), viral integration was associated with local variations in genomic copy numbers. Integrations at the TERT promoter were associated with high telomerase expression evidently activating this tumor-driving process. High levels of endogenous retrovirus (ERV1) expression were linked to a worse survival outcome in patients with kidney cancer.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Borozan, IvanOntario Institute for Cancer Research (författare)
  • Brewer, Daniel SUniversity of East Anglia (författare)
  • Iskar, MuratGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Grundhoff, AdamHeinrich Pette Institut (författare)
  • Alawi, MalikHeinrich Pette Institut (författare)
  • Desai, NikitaUniversity College London Hospital (författare)
  • Sültmann, HolgerNational Centre of Tumor Diseases,German Cancer Research Centre (författare)
  • Moch, HolgerUniversity Hospital of Zurich (författare)
  • Cooper, Colin SEarlham Institute (författare)
  • Eils, RolandGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Ferretti, VincentOntario Institute for Cancer Research (författare)
  • Lichter, PeterGerman Cancer Research Centre (författare)
  • Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments(Swepub:lu)onk-abo (creator_code:cre_t)
  • Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science(Swepub:lu)thep-mri (creator_code:cre_t)
  • Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund(Swepub:lu)onk-jst (creator_code:cre_t)
  • German Cancer Research CentreOntario Institute for Cancer Research (creator_code:org_t)
  • PCAWG Pathogens
  • PCAWG Consortium

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC52:3, s. 320-3301546-17181061-4036

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy