Sökning: WFRF:(Lundin Pär)
> (2020-2024) >
Multi-omics profili...
Multi-omics profiling to identify early plasma biomarkers in pre-diagnostic pancreatic ductal adenocarcinoma : a nested case-control study
-
- Borgmästars, Emmy (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi
-
- Ulfenborg, Benjamin, 1985- (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics,School of Bioscience, Department of Biology and Bioinformatics, University of Skövde, Skövde, Sweden
-
- Johansson, Mattias (författare)
- Genomic Epidemiology Branch, International Agency for Research on Cancer, Lyon, France
-
visa fler...
-
- Jonsson, Pär (författare)
- Umeå universitet,Kemiska institutionen
-
- Billing, Ola, 1981- (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi
-
- Franklin, Oskar, 1985- (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi,Division of Surgical Oncology, Department of Surgery, University of Colorado School of Medicine, CO, Aurora, United States
-
- Lundin, Christina, 1970- (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi
-
- Jacobson, Sara (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi
-
- Simm, Maja (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Obstetrik och gynekologi,Kirurgi
-
- Lubovac-Pilav, Zelmina (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translational Bioinformatics,School of Bioscience, Department of Biology and Bioinformatics, University of Skövde, Skövde, Sweden
-
- Sund, Malin (författare)
- Umeå universitet,Institutionen för diagnostik och intervention,Kirurgi,Department of Surgery, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier, 2024
- 2024
- Engelska.
-
Ingår i: Translational Oncology. - : Elsevier. - 1944-7124 .- 1936-5233. ; 48
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://his.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://umu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is an aggressive disease with poor survival. Novel biomarkers are urgently needed to improve the outcome through early detection. Here, we aimed to discover novel biomarkers for early PDAC detection using multi-omics profiling in pre-diagnostic plasma samples biobanked after routine health examinations.A nested case-control study within the Northern Sweden Health and Disease Study was designed. Pre-diagnostic plasma samples from 37 future PDAC patients collected within 2.3 years before diagnosis and 37 matched healthy controls were included. We analyzed metabolites using liquid chromatography mass spectrometry and gas chromatography mass spectrometry, microRNAs by HTG edgeseq, proteins by multiplex proximity extension assays, as well as three clinical biomarkers using milliplex technology. Supervised and unsupervised multi-omics integration were performed as well as univariate analyses for the different omics types and clinical biomarkers. Multiple hypothesis testing was corrected using Benjamini-Hochberg's method and a false discovery rate (FDR) below 0.1 was considered statistically significant.Carbohydrate antigen (CA) 19-9 was associated with PDAC risk (OR [95 % CI] = 3.09 [1.31–7.29], FDR = 0.03) and increased closer to PDAC diagnosis. Supervised multi-omics models resulted in poor discrimination between future PDAC cases and healthy controls with obtained accuracies between 0.429–0.500. No single metabolite, microRNA, or protein was differentially altered (FDR < 0.1) between future PDAC cases and healthy controls.CA 19-9 levels increase up to two years prior to PDAC diagnosis but extensive multi-omics analysis including metabolomics, microRNAomics and proteomics in this cohort did not identify novel early biomarkers for PDAC.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
Nyckelord
- Pancreatic neoplasms
- miRNomics
- Metabolomics
- Proteomics
- Risk
- Bioinformatik
- Bioinformatics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Borgmästars, Emm ...
-
Ulfenborg, Benja ...
-
Johansson, Matti ...
-
Jonsson, Pär
-
Billing, Ola, 19 ...
-
Franklin, Oskar, ...
-
visa fler...
-
Lundin, Christin ...
-
Jacobson, Sara
-
Simm, Maja
-
Lubovac-Pilav, Z ...
-
Sund, Malin
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
- Artiklar i publikationen
-
Translational On ...
- Av lärosätet
-
Högskolan i Skövde
-
Umeå universitet