Sökning: (WFRF:(Palsson G)) srt2:(2020-2024) >
Genome-scale recons...
Genome-scale reconstructions of the mammalian secretory pathway predict metabolic costs and limitations of protein secretion
-
- Gutierrez, Jahir M. (författare)
- University of California
-
- Feizi, Amir, 1980 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Li, Shangzhong (författare)
- University of California
-
visa fler...
-
- Kallehauge, Thomas B. (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Hefzi, Hooman (författare)
- University of California
-
- Grav, Lise M. (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Ley, Daniel (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
Baycin Hizal, Deniz (författare)
-
- Betenbaugh, Michael J. (författare)
- Johns Hopkins University
-
- Voldborg, Bjørn G. (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Faustrup Kildegaard, Helene (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Min Lee, Gyun (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Palsson, B. O. (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark,University of California
-
- Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Lewis, Nathan E. (författare)
- University of California
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020-01-02
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723 .- 2041-1723. ; 11:1
- Relaterad länk:
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://research.cha...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In mammalian cells, >25% of synthesized proteins are exported through the secretory pathway. The pathway complexity, however, obfuscates its impact on the secretion of different proteins. Unraveling its impact on diverse proteins is particularly important for biopharmaceutical production. Here we delineate the core secretory pathway functions and integrate them with genome-scale metabolic reconstructions of human, mouse, and Chinese hamster ovary cells. The resulting reconstructions enable the computation of energetic costs and machinery demands of each secreted protein. By integrating additional omics data, we find that highly secretory cells have adapted to reduce expression and secretion of other expensive host cell proteins. Furthermore, we predict metabolic costs and maximum productivities of biotherapeutic proteins and identify protein features that most significantly impact protein secretion. Finally, the model successfully predicts the increase in secretion of a monoclonal antibody after silencing a highly expressed selection marker. This work represents a knowledgebase of the mammalian secretory pathway that serves as a novel tool for systems biotechnology.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Gutierrez, Jahir ...
-
Feizi, Amir, 198 ...
-
Li, Shangzhong
-
Kallehauge, Thom ...
-
Hefzi, Hooman
-
Grav, Lise M.
-
visa fler...
-
Ley, Daniel
-
Baycin Hizal, De ...
-
Betenbaugh, Mich ...
-
Voldborg, Bjørn ...
-
Faustrup Kildega ...
-
Min Lee, Gyun
-
Palsson, B. O.
-
Nielsen, Jens B, ...
-
Lewis, Nathan E.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola