WFRF:(Esser Sarah P.)
Sökning: WFRF:(Esser Sarah P.) > A predicted CRISPR-...
A predicted CRISPR-mediated symbiosis between uncultivated archaea
-
- Esser, Sarah P. (författare)
- Univ Duisburg Essen, Germany
-
- Rahlff, Janina (författare)
- Linnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM),Univ Duisburg Essen, Germany,Ctr Ecol & Evolut Microbial Model Syst EEMiS
-
- Zhao, Weishu (författare)
- Univ Rhode Isl, USA;Shanghai Jiao Tong Univ, China
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- Nature Publishing Group, 2023
- 2023
- Engelska.
- Ingår i: Nature Microbiology. - : Nature Publishing Group. - 2058-5276. ; 8, s. 1619-1633
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- CRISPR spacers in DPANN archaea target putative essential genes in their episymbionts and could be a widespread occurrence across diverse archaeal lineages. CRISPR-Cas systems defend prokaryotic cells from invasive DNA of viruses, plasmids and other mobile genetic elements. Here, we show using metagenomics, metatranscriptomics and single-cell genomics that CRISPR systems of widespread, uncultivated archaea can also target chromosomal DNA of archaeal episymbionts of the DPANN superphylum. Using meta-omics datasets from Crystal Geyser and Horonobe Underground Research Laboratory, we find that CRISPR spacers of the hosts Candidatus Altiarchaeum crystalense and Ca. A. horonobense, respectively, match putative essential genes in their episymbionts' genomes of the genus Ca. Huberiarchaeum and that some of these spacers are expressed in situ. Metabolic interaction modelling also reveals complementation between host-episymbiont systems, on the basis of which we propose that episymbionts are either parasitic or mutualistic depending on the genotype of the host. By expanding our analysis to 7,012 archaeal genomes, we suggest that CRISPR-Cas targeting of genomes associated with symbiotic archaea evolved independently in various archaeal lineages.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Ekologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Ecology (hsv//eng)
Nyckelord
- Mikrobiologi
- Microbiology
- Miljövetenskap
- Environmental Science
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Esser, Sarah P.
- Rahlff, Janina
- Zhao, Weishu
- Predl, Michael
- Plewka, Julia
- Sures, Katharina
- visa fler...
- Wimmer, Franzisk ...
- Lee, Janey
- Adam, Panagiotis ...
- McGonigle, Julia
- Turzynski, Victo ...
- Banas, Indra
- Schwank, Katrin
- Krupovic, Mart
- Bornemann, Till ...
- Figueroa-Gonzale ...
- Jarett, Jessica
- Rattei, Thomas
- Amano, Yuki
- Blaby, Ian K.
- Cheng, Jan-Fang
- Brazelton, Willi ...
- Beisel, Chase L.
- Woyke, Tanja
- Zhang, Ying
- Probst, Alexande ...
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Mikrobiologi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Ekologi
- Artiklar i publikationen
- Nature Microbiol ...
- Av lärosätet
- Linnéuniversitetet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
