SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Orre Ann Charlotte)
 

Sökning: WFRF:(Orre Ann Charlotte) > Analysis of human l...

  • Ronnberg, ElinKarolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)

Analysis of human lung mast cells by single cell RNA sequencing

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2023-03-30
  • Frontiers Media S.A.2023
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-501963
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-501963URI
  • https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1151754DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-216998URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:152458783URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Mast cells are tissue-resident cells playing major roles in homeostasis and disease conditions. Lung mast cells are particularly important in airway inflammatory diseases such as asthma. Human mast cells are classically divided into the subsets MCT and MCTC, where MCT express the mast cell protease tryptase and MCTC in addition express chymase, carboxypeptidase A3 (CPA3) and cathepsin G. Apart from the disctintion of the MCT and MCTC subsets, little is known about the heterogeniety of human lung mast cells and a deep analysis of their heterogeniety has previously not been performed. We therefore performed single cell RNA sequencing on sorted human lung mast cells using SmartSeq2. The mast cells showed high expression of classical mast cell markers. The expression of several individual genes varied considerably among the cells, however, no subpopulations were detected by unbiased clustering. Variable genes included the protease-encoding transcripts CMA1 (chymase) and CTSG (cathepsin G). Human lung mast cells are predominantly of the MCT subset and consistent with this, the expression of CMA1 was only detectable in a small proportion of the cells, and correlated moderately to CTSG. However, in contrast to established data for the protein, CPA3 mRNA was high in all cells and the correlation of CPA3 to CMA1 was weak.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Ravindran, AvinashKarolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Mazzurana, LucaKarolinska Inst, Dept Med Huddinge, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Gong, YitaoKarolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Safholm, JesperKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Inst Environm Med, Res Ctr Allergy Res, Unit Expt Asthma & Allergy, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Lorent, Julie,1986-Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för biokemi och biofysik,Stockholm Univ, Sci Life Lab, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Stockholm, Sweden.(Swepub:su)julo1472 (författare)
  • Dethlefsen, Olga,1983-Stockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för biokemi och biofysik,Stockholm Univ, Sci Life Lab, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Stockholm, Sweden.(Swepub:su)ohryd (författare)
  • Orre, Ann-CharlotteKarolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Dept Mol Med & Surg, Thorac Surg, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Al-Ameri, MamdohKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Dept Mol Med & Surg, Thorac Surg, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Adner, MikaelKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Inst Environm Med, Res Ctr Allergy Res, Unit Expt Asthma & Allergy, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Dahlen, Sven-ErikKarolinska Inst, Inst Environm Med, Res Ctr Allergy Res, Unit Expt Asthma & Allergy, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Dahlin, Joakim S.Karolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Mjosberg, JennyKarolinska Inst, Dept Med Huddinge, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Nilsson, GunnarKarolinska Institutet,Uppsala universitet,Hematologi,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.(Swepub:uu)gunnarns (författare)
  • Karolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.Karolinska Inst, Dept Med Solna, Div Immunol & Allergy, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Dept Med Huddinge, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Frontiers in Immunology: Frontiers Media S.A.141664-3224

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy