Graph networks for molecular design

Rastemo, Tobias (författare): Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,AstraZeneca AB

Lindelöf, Edvard, 1992 (författare): Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,AstraZeneca AB

Klambauer, Gunter (författare): Johannes Kepler Universität Linz (JKU),Johannes Kepler University of Linz (JKU)

Chen, Hongming (författare)

(creator_code:org_t)

2021-03-02
2021
Engelska.
Ingår i: Machine Learning: Science and Technology. - : IOP Publishing. - 2632-2153. ; 2:2

Relaterad länk:: https://research.cha... (primary) (free); visa fler...; https://doi.org/10.1...; https://research.cha...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Abstract Ämnesord

Stäng

Deep learning methods applied to chemistry can be used to accelerate the discovery of new molecules. This work introduces GraphINVENT, a platform developed for graph-based molecular design using graph neural networks (GNNs). GraphINVENT uses a tiered deep neural network architecture to probabilistically generate new molecules a single bond at a time. All models implemented in GraphINVENT can quickly learn to build molecules resembling the training set molecules without any explicit programming of chemical rules. The models have been benchmarked using the MOSES distribution-based metrics, showing how GraphINVENT models compare well with state-of-the-art generative models. This work compares six different GNN-based generative models in GraphINVENT, and shows that ultimately the gated-graph neural network performs best against the metrics considered here.

NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Annan data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Other Computer and Information Science (hsv//eng)
NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Elektroteknik och elektronik -- Datorsystem (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Electrical Engineering, Electronic Engineering, Information Engineering -- Computer Systems (hsv//eng)

Av författaren/redakt...: Mercado, Rocio, ...; Rastemo, Tobias; Lindelöf, Edvard ...; Klambauer, Gunte ...; Engkvist, Ola; Chen, Hongming; visa fler...; Bjerrum, Esben J ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Annan data och i ...

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Elektroteknik oc ...; och Datorsystem

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.