WFRF:(Hayat Sikander)
Sökning: WFRF:(Hayat Sikander) > Localization predic...
Localization prediction and structure-based in silico analysis of bacterial proteins : with emphasis on outer membrane proteins.
- Imai, Kenichiro (författare)
-
- Hayat, Sikander (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
- Sakiyama, Noriyuki (författare)
- visa fler...
- Fujita, Naoya (författare)
- Tomii, Kentaro (författare)
- Horton, Paul (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2012-09-08
- 2013
- Engelska.
- Ingår i: Data Mining for Systems Biology. - New York : Humana Press. - 9781627031066 - 9781627031073 ; , s. 115-140
- Bokkapitel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In this chapter, we first discuss protein localization in bacteria and evaluate some localization prediction tools on an independent dataset. Next, we focus on β-barrel outer membrane proteins (BOMPs), describing and evaluating new tools for BOMP detection and topology prediction. Finally, we apply general protein structure prediction methods on these proteins to show that the structure of most BOMPs in E. coli can be modeled reliably.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Protein localization
- Topologyprediction
- β-barrelmembrane proteins
- SVM
- HMM
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- kap (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
- Data Mining for Systems Biology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Imai, Kenichiro
- Hayat, Sikander
- Sakiyama, Noriyu ...
- Fujita, Naoya
- Tomii, Kentaro
- Elofsson, Arne
- visa fler...
- Horton, Paul
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
- Data Mining for ...
- Av lärosätet
- Stockholms universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
