SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Holtkamp S)
 

Sökning: WFRF:(Holtkamp S) > Automatic and manua...

Automatic and manual segmentation of the piriform cortex: Method development and validation in patients with temporal lobe epilepsy and Alzheimer's disease.

Steinbart, David (författare)
Yaakub, Siti N (författare)
Steinbrenner, Mirja (författare)
visa fler...
Guldin, Lynn S (författare)
Holtkamp, Martin (författare)
Keller, Simon S (författare)
Weber, Bernd (författare)
Rüber, Theodor (författare)
Heckemann, Rolf A. (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för medicinsk strålningsvetenskap,Institute of Clinical Sciences, Department of Medical Radiation Sciences
Ilyas-Feldmann, Maria (författare)
Hammers, Alexander (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2023
2023
Engelska.
Ingår i: Human brain mapping. - 1065-9471 .- 1097-0193. ; 44:8, s. 3196-3209
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The piriform cortex (PC) is located at the junction of the temporal and frontal lobes. It is involved physiologically in olfaction as well as memory and plays an important role in epilepsy. Its study at scale is held back by the absence of automatic segmentation methods on MRI. We devised a manual segmentation protocol for PC volumes, integrated those manually derived images into the Hammers Atlas Database (n=30) and used an extensively validated method (multi-atlas propagation with enhanced registration, MAPER) for automatic PC segmentation. We applied automated PC volumetry to patients with unilateral temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis (TLE; n=174 including n=58 controls) and to the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative cohort (ADNI; n=151, of whom with mild cognitive impairment (MCI), n=71; Alzheimer's disease (AD), n=33; controls, n=47). In controls, mean PC volume was 485mm3 on the right and 461mm3 on the left. Automatic and manual segmentations overlapped with a Jaccard coefficient (intersection/union) of ~0.5 and a mean absolute volume difference of ~22mm3 in healthy controls, ~0.40/ ~28mm3 in patients with TLE, and~0.34/~29mm3 in patients with AD. In patients with TLE, PC atrophy lateralised to the side of hippocampal sclerosis (p<.001). In patients with MCI and AD, PC volumes were lower than those of controls bilaterally (p<.001). Overall, we have validated automatic PC volumetry in healthy controls and two types of pathology. The novel finding of early atrophy of PC at the stage of MCI possibly adds a novel biomarker. PC volumetry can now be applied at scale.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Radiologi och bildbehandling (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Radiology, Nuclear Medicine and Medical Imaging (hsv//eng)

Nyckelord

Hammers Atlas Database
MAPER
hippocampal sclerosis
mild cognitive impairment
morphometry

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy