Sökning: WFRF:(Mandelson Margaret) >
Pathway analysis of...
Pathway analysis of genome-wide association study data highlights pancreatic development genes as susceptibility factors for pancreatic cancer
-
Li, Donghui (författare)
-
Duell, Eric J. (författare)
-
Yu, Kai (författare)
-
visa fler...
-
Risch, Harvey A. (författare)
-
Olson, Sara H. (författare)
-
Kooperberg, Charles (författare)
-
Wolpin, Brian M. (författare)
-
Jiao, Li (författare)
-
Dong, Xiaoqun (författare)
-
Wheeler, Bill (författare)
-
Arslan, Alan A. (författare)
-
Bueno-de-Mesquita, H. Bas (författare)
-
Fuchs, Charles S. (författare)
-
Gallinger, Steven (författare)
-
Gross, Myron (författare)
-
Hartge, Patricia (författare)
-
Hoover, Robert N. (författare)
-
Holly, Elizabeth A. (författare)
-
Jacobs, Eric J. (författare)
-
Klein, Alison P. (författare)
-
LaCroix, Andrea (författare)
-
Mandelson, Margaret T. (författare)
-
Petersen, Gloria (författare)
-
Zheng, Wei (författare)
-
Agalliu, Ilir (författare)
-
Albanes, Demetrius (författare)
-
Boutron-Ruault, Marie-Christine (författare)
-
Bracci, Paige M. (författare)
-
Buring, Julie E. (författare)
-
Canzian, Federico (författare)
-
Chang, Kenneth (författare)
-
Chanock, Stephen J. (författare)
-
Cotterchio, Michelle (författare)
-
Gaziano, J. Michael (författare)
-
Giovannucci, Edward L. (författare)
-
Goggins, Michael (författare)
-
- Hallmans, Göran, 1947- (författare)
- Umeå universitet,Näringsforskning
-
Hankinson, Susan E. (författare)
-
Bolton, Judith A. Hoffman (författare)
-
Hunter, David J. (författare)
-
Hutchinson, Amy (författare)
-
Jacobs, Kevin B. (författare)
-
Jenab, Mazda (författare)
-
Khaw, Kay-Tee (författare)
-
Kraft, Peter (författare)
-
Krogh, Vittorio (författare)
-
Kurtz, Robert C. (författare)
-
McWilliams, Robert R. (författare)
-
Mendelsohn, Julie B. (författare)
-
Patel, Alpa V. (författare)
-
Rabe, Kari G. (författare)
-
Riboli, Elio (författare)
-
Shu, Xiao-Ou (författare)
-
Tjonneland, Anne (författare)
-
Tobias, Geoffrey S. (författare)
-
Trichopoulos, Dimitrios (författare)
-
Virtamo, Jarmo (författare)
-
Visvanathan, Kala (författare)
-
Watters, Joanne (författare)
-
Yu, Herbert (författare)
-
Zeleniuch-Jacquotte, Anne (författare)
-
Amundadottir, Laufey (författare)
-
Stolzenberg-Solomon, Rachael Z. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2012-04-20
- 2012
- Engelska.
-
Ingår i: Carcinogenesis. - : Oxford University Press. - 0143-3334 .- 1460-2180. ; 33:7, s. 1384-1390
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Four loci have been associated with pancreatic cancer through genome-wide association studies (GWAS). Pathway-based analysis of GWAS data is a complementary approach to identify groups of genes or biological pathways enriched with disease-associated single-nucleotide polymorphisms (SNPs) whose individual effect sizes may be too small to be detected by standard single-locus methods. We used the adaptive rank truncated product method in a pathway-based analysis of GWAS data from 3851 pancreatic cancer cases and 3934 control participants pooled from 12 cohort studies and 8 case-control studies (PanScan). We compiled 23 biological pathways hypothesized to be relevant to pancreatic cancer and observed a nominal association between pancreatic cancer and five pathways (P < 0.05), i.e. pancreatic development, Helicobacter pylori lacto/neolacto, hedgehog, Th1/Th2 immune response and apoptosis (P = 2.0 x 10(-6), 1.6 x 10(-5), 0.0019, 0.019 and 0.023, respectively). After excluding previously identified genes from the original GWAS in three pathways (NR5A2, ABO and SHH), the pancreatic development pathway remained significant (P = 8.3 x 10(-5)), whereas the others did not. The most significant genes (P < 0.01) in the five pathways were NR5A2, HNF1A, HNF4G and PDX1 for pancreatic development; ABO for H.pylori lacto/neolacto; SHH for hedgehog; TGFBR2 and CCL18 for Th1/Th2 immune response and MAPK8 and BCL2L11 for apoptosis. Our results provide a link between inherited variation in genes important for pancreatic development and cancer and show that pathway-based approaches to analysis of GWAS data can yield important insights into the collective role of genetic risk variants in cancer.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Li, Donghui
-
Duell, Eric J.
-
Yu, Kai
-
Risch, Harvey A.
-
Olson, Sara H.
-
Kooperberg, Char ...
-
visa fler...
-
Wolpin, Brian M.
-
Jiao, Li
-
Dong, Xiaoqun
-
Wheeler, Bill
-
Arslan, Alan A.
-
Bueno-de-Mesquit ...
-
Fuchs, Charles S ...
-
Gallinger, Steve ...
-
Gross, Myron
-
Hartge, Patricia
-
Hoover, Robert N ...
-
Holly, Elizabeth ...
-
Jacobs, Eric J.
-
Klein, Alison P.
-
LaCroix, Andrea
-
Mandelson, Marga ...
-
Petersen, Gloria
-
Zheng, Wei
-
Agalliu, Ilir
-
Albanes, Demetri ...
-
Boutron-Ruault, ...
-
Bracci, Paige M.
-
Buring, Julie E.
-
Canzian, Federic ...
-
Chang, Kenneth
-
Chanock, Stephen ...
-
Cotterchio, Mich ...
-
Gaziano, J. Mich ...
-
Giovannucci, Edw ...
-
Goggins, Michael
-
Hallmans, Göran, ...
-
Hankinson, Susan ...
-
Bolton, Judith A ...
-
Hunter, David J.
-
Hutchinson, Amy
-
Jacobs, Kevin B.
-
Jenab, Mazda
-
Khaw, Kay-Tee
-
Kraft, Peter
-
Krogh, Vittorio
-
Kurtz, Robert C.
-
McWilliams, Robe ...
-
Mendelsohn, Juli ...
-
Patel, Alpa V.
-
Rabe, Kari G.
-
Riboli, Elio
-
Shu, Xiao-Ou
-
Tjonneland, Anne
-
Tobias, Geoffrey ...
-
Trichopoulos, Di ...
-
Virtamo, Jarmo
-
Visvanathan, Kal ...
-
Watters, Joanne
-
Yu, Herbert
-
Zeleniuch-Jacquo ...
-
Amundadottir, La ...
-
Stolzenberg-Solo ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Carcinogenesis
- Av lärosätet
-
Umeå universitet