SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Kononen Juha)
 

Sökning: WFRF:(Kononen Juha) > A high-throughput s...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00004174naa a2200565 4500
001oai:DiVA.org:kth-14253
003SwePub
008100728s2007 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:DiVA.org:uu-97143
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-142532 URI
0247 a https://doi.org/10.1002/pmic.2007001992 DOI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-971432 URI
040 a (SwePub)kthd (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Strömberg, Sarau Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut
2451 0a A high-throughput strategy for protein profiling in cell microarrays using automated image analysis
264 1b Wiley,c 2007
338 a print2 rdacarrier
500 a QC 20100728
520 a Advances in antibody production render a growing supply of affinity reagents for immunohistochemistry (IHC), and tissue microarray (TMA) technologies facilitate simultaneous analysis of protein expression in a multitude of tissues. However, collecting validated IHC data remains a bottleneck problem, as the standard method is manual microscopical analysis. Here we present a high-throughput strategy combining IHC on a recently developed cell microarray with a novel, automated image-analysis application (TMAx). The software was evaluated on 200 digital images of IHC-stained cell spots, by comparing TMAx annotation with manual annotation performed by seven human experts. A high concordance between automated and manual annotation of staining intensity and fraction of IHC-positive cells was found. in a limited study, we also investigated the possibility to assess the correlation between mRNA and protein levels, by using TMAx output results for relative protein quantification and quantitative real-time PCR for the quantification of corresponding transcript levels. In conclusion, automated analysis of immunohistochemically stained in vitro-cultured cells in a microarray format can be used for high-throughput protein profiling, and extraction of RNA from the same cell lines provides a basis for comparing transcription and protein expression on a global scale.
650 7a TEKNIK OCH TEKNOLOGIERx Industriell bioteknik0 (SwePub)2092 hsv//swe
650 7a ENGINEERING AND TECHNOLOGYx Industrial Biotechnology0 (SwePub)2092 hsv//eng
653 a antibody proteornics
653 a automated image analysis
653 a cell line
653 a immunohistochemistry
653 a tissue microarray
653 a Bioengineering
653 a Bioteknik
653 a MEDICINE
7001 a Gry Björklund, Marcusu KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u1dzuui2
7001 a Asplund, Carolineu KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u1g2rvfy
7001 a Sköllermo, Annau KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u19pupan
7001 a Persson, Anjau KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u1ub8a38
7001 a Wester, Kennethu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)kennwest
7001 a Kampf, Carolineu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)carokamp
7001 a Nilsson, Peteru KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u1ws88sk
7001 a Andersson, Ann-Catrinu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut
7001 a Uhlén, Mathiasu KTH,Proteomik4 aut0 (Swepub:kth)u1dulvmw
7001 a Kononen, Juhau Beecher Instruments, Sun Prairie, WI, United States4 aut
7001 a Pontén, Fredriku Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)fredpont
7001 a Asplund, Annau Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)annaaspl
7102 a Uppsala universitetb Institutionen för genetik och patologi4 org
7730 t Proteomicsd : Wileyg 7:13, s. 2142-2150q 7:13<2142-2150x 1615-9853x 1615-9861
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-14253
8564 8u https://doi.org/10.1002/pmic.200700199
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-97143

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy