Whole-genome expression profiling of human plaques to identify genes relevant for atherosclerosis: the Stockholm Atherosclerosis Gene Expression Study, Stockholm Söder Hospital, Sweden (SöS-STAGE)

Whole-genome expression profiling of human plaques to identify genes relevant for atherosclerosis : the Stockholm Atherosclerosis Gene Expression Study, Stockholm Söder Hospital, Sweden (SöS-STAGE)

ObjectiveTo reveal relevant genes for atherosclerosis by whole-genome expression analyses of plaques from patients undergoing carotid endorectomy.Methods and ResultsWhole-genome expression measurements (WGEM) using Affymetrix HG-U133_Plus_2 chip of carotid plaques in patients undergoing carotid endorectomy at Stockholm Söder Hospital, Sweden. Patients were screened for conventional risk factors at a three-month follow-up visit and atherosclerosis burden in the common carotid artery (CCA) was measured by intima-media thickness (IMT). An unsupervised coupled two-way clustering approach identified genderspecific genes and 55 genes associated to degree of IMT in these patients.ConclusionsCoupled two-way clustering of carotid lesion expression profiles from a well-characterized clinical cohort is useful for identification of novel genes that may be relevant for atheroscleroris.

Hägg, SaraLinköpings universitet,Biologiska Beräkningar,Tekniska högskolan(Swepub:liu)sarha47 (författare)
Lundström, Jesper (författare)
Bradshaw, Maria (författare)
Konrad, Peter (författare)
Takolander, Rabbe (författare)
Rosfors, Stefan (författare)
Hamsten, Anders (författare)
Tegnér, Jesper (författare)
Björkegren, Johan (författare)
Linköpings universitetBiologiska Beräkningar (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Skogsberg, Josef ...; Hägg, Sara; Lundström, Jespe ...; Bradshaw, Maria; Konrad, Peter; Takolander, Rabb ...; visa fler...; Rosfors, Stefan; Hamsten, Anders; Tegnér, Jesper; Björkegren, Joha ...; visa färre...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.