SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Noble Charleston)
 

Sökning: WFRF:(Noble Charleston) > A fast and scalable...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00005075naa a2200493 4500
001oai:lup.lub.lu.se:0049b0ec-50dd-4b0b-9655-3900f6b78258
003SwePub
008160401s2015 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:gup.ub.gu.se/226302
024a https://lup.lub.lu.se/record/53417832 URI
024a https://doi.org/10.1371/journal.pone.01219052 DOI
024a https://gup.ub.gu.se/publication/2263022 URI
040 a (SwePub)lud (SwePub)gu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a art2 swepub-publicationtype
072 7a ref2 swepub-contenttype
100a Noble, Charlestonu Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science4 aut0 (Swepub:lu)thep-can
2451 0a A fast and scalable kymograph alignment algorithm for nanochannel-based optical DNA mappings.
264 c 2015-04-13
264 1b Public Library of Science (PLoS),c 2015
520 a Optical mapping by direct visualization of individual DNA molecules, stretched in nanochannels with sequence-specific fluorescent labeling, represents a promising tool for disease diagnostics and genomics. An important challenge for this technique is thermal motion of the DNA as it undergoes imaging; this blurs fluorescent patterns along the DNA and results in information loss. Correcting for this effect (a process referred to as kymograph alignment) is a common preprocessing step in nanochannel-based optical mapping workflows, and we present here a highly efficient algorithm to accomplish this via pattern recognition. We compare our method with the one previous approach, and we find that our method is orders of magnitude faster while producing data of similar quality. We demonstrate proof of principle of our approach on experimental data consisting of melt mapped bacteriophage DNA.
650 7a NATURVETENSKAPx Fysikx Den kondenserade materiens fysik0 (SwePub)103042 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Physical Sciencesx Condensed Matter Physics0 (SwePub)103042 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biofysik0 (SwePub)106032 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biophysics0 (SwePub)106032 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Fysikx Annan fysik0 (SwePub)103992 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Physical Sciencesx Other Physics Topics0 (SwePub)103992 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Fysik0 (SwePub)1032 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Physical Sciences0 (SwePub)1032 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Data- och informationsvetenskap0 (SwePub)1022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Computer and Information Sciences0 (SwePub)1022 hsv//eng
700a Nilsson, Adamu Lund University,Lunds universitet,Atomfysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Atomic Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)fysi-adn
700a Freitag, Camillau Gothenburg University,Göteborgs universitet,University of Gothenburg,Lund University,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)4 aut
700a Beech, Jasonu Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)ftf-job
700a Tegenfeldt, Jonasu Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)ftf-jte
700a Ambjörnsson, Tobiasu Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science4 aut0 (Swepub:lu)thep-tar
710a Fasta tillståndets fysikb Fysiska institutionen4 org
773t PLoS ONEd : Public Library of Science (PLoS)g 10:4q 10:4x 1932-6203
856u http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0121905x freey FULLTEXT
856u https://journals.plos.org/plosone/article/file?id=10.1371/journal.pone.0121905&type=printable
8564 8u https://lup.lub.lu.se/record/5341783
8564 8u https://doi.org/10.1371/journal.pone.0121905
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/226302

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy