Sökning: WFRF:(Säfholm Jesper) >
Tissue-specific tra...
Tissue-specific transcriptional imprinting and heterogeneity in human innate lymphoid cells revealed by full-length single-cell RNA-sequencing
-
- Mazzurana, Luca (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden.
-
- Czarnewski, Paulo (författare)
- Stockholm University,Stockholm Univ, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Sci Life Lab, Dept Biochem & Biophys, Solna, Sweden.
-
- Jonsson, Viktor, 1987 (författare)
- Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol & Biol Engn, Sci Life Lab, Gothenburg, Sweden.
-
visa fler...
-
- Wigge, Leif, 1986 (författare)
- Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol & Biol Engn, Sci Life Lab, Gothenburg, Sweden.
-
- Ringnér, Markus (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science,Lund Univ, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol, Sci Life Lab, Lund, Sweden.
-
- Williams, Teresa C. (författare)
- Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden.
-
- Ravindran, Avinash (författare)
- Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Immunol & Allergy Unit, Dept Med Solna,Dept Clin Immunol & Transfus Med, Stockholm, Sweden.
-
- Björklund, Åsa K. (författare)
- Uppsala universitet,Uppsala University,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär evolution
-
- Säfholm, Jesper (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Ctr Allergy Res, Inst Environm Med, Stockholm, Sweden.
-
- Nilsson, Gunnar (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Immunol & Allergy Unit, Dept Med Solna,Dept Clin Immunol & Transfus Med, Stockholm, Sweden.
-
- Dahlén, Sven Erik (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Ctr Allergy Res, Inst Environm Med, Stockholm, Sweden.
-
- Orre, Ann Charlotte (författare)
- Karolinska universitetssjukhuset,Karolinska University Hospital,Karolinska Univ Hosp, Div Thorac Surg, Stockholm, Sweden.
-
- Al-Ameri, Mamdoh (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Univ Hosp, Div Thorac Surg, Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
-
- Höög, Charlotte (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden.
-
- Hedin, Charlotte (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Med Unit Gastroenterol Dermatovenereol & Rheumato, Div Gastroenterol, Stockholm, Sweden.
-
- Szczegielniak, Sylwester (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Almer, Sven (författare)
- Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Med Unit Gastroenterol Dermatovenereol & Rheumato, Div Gastroenterol, Stockholm, Sweden.
-
- Mjösberg, Jenny (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden.
-
visa färre...
-
Karolinska Institute Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden (creator_code:org_t)
- 2021-01-08
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Cell Research. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1748-7838 .- 1001-0602. ; 31:5, s. 554-568
- Relaterad länk:
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The impact of the microenvironment on innate lymphoid cell (ILC)-mediated immunity in humans remains largely unknown. Here we used full-length Smart-seq2 single-cell RNA-sequencing to unravel tissue-specific transcriptional profiles and heterogeneity of CD127+ ILCs across four human tissues. Correlation analysis identified gene modules characterizing the migratory properties of tonsil and blood ILCs, and signatures of tissue-residency, activation and modified metabolism in colon and lung ILCs. Trajectory analysis revealed potential differentiation pathways from circulating and tissue-resident naïve ILCs to a spectrum of mature ILC subsets. In the lung we identified both CRTH2+ and CRTH2− ILC2 with lung-specific signatures, which could be recapitulated by alarmin-exposure of circulating ILC2. Finally, we describe unique TCR-V(D)J-rearrangement patterns of blood ILC1-like cells, revealing a subset of potentially immature ILCs with TCR-δ rearrangement. Our study provides a useful resource for in-depth understanding of ILC-mediated immunity in humans, with implications for disease.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Immunologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Immunology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Immunologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Immunology in the medical area (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Mazzurana, Luca
-
Czarnewski, Paul ...
-
Jonsson, Viktor, ...
-
Wigge, Leif, 198 ...
-
Ringnér, Markus
-
Williams, Teresa ...
-
visa fler...
-
Ravindran, Avina ...
-
Björklund, Åsa K ...
-
Säfholm, Jesper
-
Nilsson, Gunnar
-
Dahlén, Sven Eri ...
-
Orre, Ann Charlo ...
-
Al-Ameri, Mamdoh
-
Höög, Charlotte
-
Hedin, Charlotte
-
Szczegielniak, S ...
-
Almer, Sven
-
Mjösberg, Jenny
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Immunologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Immunologi inom ...
- Artiklar i publikationen
-
Cell Research
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Lunds universitet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet