WFRF:(Klevebring Daniel)
Sökning: WFRF:(Klevebring Daniel) > In-depth transcript...
In-depth transcriptome analysis reveals novel TARs and prevalent antisense transcription in human cell lines.
-
- Klevebring, Daniel, 1981- (författare)
- KTH,Genteknologi,Division of Gene Technology
-
- Bjursell, Magnus K (författare)
- KTH,Genteknologi,Division of Gene Technology
-
- Emanuelsson, Olof (författare)
- KTH,Genteknologi,Division of Gene Technology
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- Engelska.
- Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Several recent studies have indicated that transcription is pervasive in regions outside of protein coding genes and that short antisense transcripts can originate from the promoter and terminator regions of genes. Here we investigate transcription of fragments longer than 200 nucleotides, focusing on antisense transcription for known protein coding genes and intergenic transcription. We find that roughly 12% to 16% of all reads that originate from promoter and terminator regions, respectively, map antisense to the gene in question. Furthermore, we detect a high number of novel transcriptionally active regions (TARs) that are generally expressed at a lower level than protein coding genes. We also investigate the correlation between RNA-seq data and microarray data and conclude that the correlation is dependant on gene length such that longer genes show a better correlation.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Annan biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Other Biological Topics (hsv//eng)
Nyckelord
- Transcriptome
- non-coding RNA
- DNA sequencing
- next generation sequencing
- Functional genomics
- Funktionsgenomik
Publikations- och innehållstyp
- vet (ämneskategori)
- ovr (ämneskategori)
Till lärosätets databas
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Klevebring, Dani ...
- Bjursell, Magnus ...
- Emanuelsson, Olo ...
- Lundeberg, Joaki ...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Annan biologi
- Av lärosätet
- Kungliga Tekniska Högskolan
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
