WFRF:(Muthas Daniel)
Sökning: WFRF:(Muthas Daniel) > Focused hierarchica...
- Muthas, DanielUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi (författare)
Focused hierarchical design of peptide libraries - follow the lead
- Artikel/kapitelEngelska2007
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- Wiley,2007
- printrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-17025
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-17025URI
- https://doi.org/10.1002/cem.1069DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- A novel design strategy based on the hierarchical design of experiments (HDoE) method named focused hierarchical design of experiments (FHDoE) is presented. FHDoE combine two design layers and use focused substitutions to increase the probability of obtaining active peptides when designing libraries through a selection of compounds biased towards a lead structure. Increasing the number of peptides with measurable activity will increase the information gained and the likelihood of constructing good quantitative structure-activity relationship (QSAR) models. The utility of the novel design method is verified using two different approaches. First, a library designed with the novel FHDoE method was compared with libraries generated from classical positional scanning techniques (e.g., alanine scan) as well as with general and centered minimum analog peptide sets (MAPS) libraries by using an example found in the literature. Secondly, the same design strategies were applied to a dataset of 58 angiotensin converting enzyme (ACE) dipeptide inhibitors. QSAR models were generated from designed sublibraries and the activities of the remaining compounds were predicted. These two examples show that the use of FHDoE renders peptide libraries close in physicochemical space to the native ligand, yielding a more thorough screening of the area of interest as compared to the classical positional scans and fractional factorial design (FFD). It is also shown that an FHDoE library of six dipeptides could produce a QSAR model that better described the requisites of high activity ACE inhibitors than could QSAR models built from either a nine-dipeptide library designed with MAPS or a 58-dipeptide library.
Ämnesord och genrebeteckningar
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Farmaceutiska vetenskaper hsv//swe
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Pharmaceutical Sciences hsv//eng
- design of experiments
- peptide library design
- hierarchical design
- amino acid z-scales
- PCA
- PHARMACY
- FARMACI
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Lek, Per M. (författare)
- Nurbo, JohannaUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)jonur676 (författare)
- Karlén, AndersUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)anderskl (författare)
- Lundstedt, TorbjörnUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)tolun677 (författare)
- Uppsala universitetInstitutionen för läkemedelskemi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Journal of Chemometrics: Wiley21:10-11, s. 486-4950886-93831099-128X
Internetlänk
Hitta via bibliotek
- Journal of Chemometrics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Muthas, Daniel
- Lek, Per M.
- Nurbo, Johanna
- Karlén, Anders
- Lundstedt, Torbj ...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Farmaceutiska ve ...
- Artiklar i publikationen
- Journal of Chemo ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
