Whole-genome expression profiling of human plaques to identify genes relevant for atherosclerosis: the Stockholm Atherosclerosis Gene Expression Study, Stockholm Söder Hospital, Sweden (SöS-STAGE)

Whole-genome expression profiling of human plaques to identify genes relevant for atherosclerosis : the Stockholm Atherosclerosis Gene Expression Study, Stockholm Söder Hospital, Sweden (SöS-STAGE)

Skogsberg, Josefin (författare)

Hägg, Sara (författare): Linköpings universitet,Biologiska Beräkningar,Tekniska högskolan

Lundström, Jesper (författare)

Bradshaw, Maria (författare)

Konrad, Peter (författare)

Takolander, Rabbe (författare)

Rosfors, Stefan (författare)

Hamsten, Anders (författare)

Tegnér, Jesper (författare)

Björkegren, Johan (författare)

(creator_code:org_t)

Abstract Ämnesord

Stäng

ObjectiveTo reveal relevant genes for atherosclerosis by whole-genome expression analyses of plaques from patients undergoing carotid endorectomy.Methods and ResultsWhole-genome expression measurements (WGEM) using Affymetrix HG-U133_Plus_2 chip of carotid plaques in patients undergoing carotid endorectomy at Stockholm Söder Hospital, Sweden. Patients were screened for conventional risk factors at a three-month follow-up visit and atherosclerosis burden in the common carotid artery (CCA) was measured by intima-media thickness (IMT). An unsupervised coupled two-way clustering approach identified genderspecific genes and 55 genes associated to degree of IMT in these patients.ConclusionsCoupled two-way clustering of carotid lesion expression profiles from a well-characterized clinical cohort is useful for identification of novel genes that may be relevant for atheroscleroris.

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.