GWAS and colocalization analyses implicate carotid intima-media thickness and carotid plaque loci in cardiovascular outcomes

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/277910" > GWAS and colocaliza...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Abstract Ämnesord

Stäng

Carotid artery intima media thickness (cIMT) and carotid plaque are measures of subclinical atherosclerosis associated with ischemic stroke and coronary heart disease (CHD). Here, we undertake meta-analyses of genome-wide association studies (GWAS) in 71,128 individuals for cIMT, and 48,434 individuals for carotid plaque traits. We identify eight novel susceptibility loci for cIMT, one independent association at the previously-identified PINX1 locus, and one novel locus for carotid plaque. Colocalization analysis with nearby vascular expression quantitative loci (cis-eQTLs) derived from arterial wall and metabolic tissues obtained from patients with CHD identifies candidate genes at two potentially additional loci, ADAMTS9 and LOXL4. LD score regression reveals significant genetic correlations between cIMT and plaque traits, and both cIMT and plaque with CHD, any stroke subtype and ischemic stroke. Our study provides insights into genes and tissue-specific regulatory mechanisms linking atherosclerosis both to its functional genomic origins and its clinical consequences in humans. © 2018, The Author(s).

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Kardiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cardiac and Cardiovascular Systems (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

ADAMTS9 protein
apolipoprotein E
loxl4 protein
protein
unclassified drug
cardiovascular disease
cell
cell component
gene expression
genetic analysis
genomics
stroke
adipose derived stem cell
arterial wall thickness
artery wall
Article
B scan
brain ischemia
cardiovascular system
carotid atherosclerosis
cell adhesion
cerebrovascular accident
CFDP1-TMEM170A gene
chromosome 7
chromosome 8
clinical outcome
coronary artery disease
disease association
EDNRA gene
epigenetics
expression quantitative trait locus
gene
gene control
gene frequency
gene locus
genetic correlation
genetic epidemiology
genetic regulation
genetic risk
genetic susceptibility
genetic variability
genome-wide association study
heart atrium appendage
human
human cell
internal mammary artery
ischemic heart disease
mesenchymal stem cell
nonhuman
PIK3CG gene
regulatory mechanism
single nucleotide polymorphism
STEAP2-AS1 gene
tibial artery
TMCO5B gene

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Nature Communications (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Uppsala universitet

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Franceschini, N.; Giambartolomei, ...; de Vries, P. S.; Finan, C.; Jern, Christina, ...; Huntley, R. P.; visa fler...; Lovering, R. C.; Tajuddin, S. M.; Tatlisumak, Turg ...; Graff, M.; Kavousi, M.; Dale, C.; Smith, A. V.; Hofer, E.; van Leeuwen, E. ...; Nolte, I. M.; Lu, L.; Scholz, M.; Sargurupremraj, ...; Pitkänen, N.; Franzén, O.; Joshi, P. K.; Noordam, R.; Marioni, R. E.; Hwang, S. J.; Musani, S. K.; Schminke, U.; Palmas, W.; Isaacs, A.; Correa, A.; Zonderman, A. B.; Hofman, A.; Teumer, A.; Cox, A. J.; Uitterlinden, A. ...; Wong, A.; Smit, A. J.; Newman, A. B.; Britton, A.; Ruusalepp, A.; Sennblad, Bengt; Hedblad, Bo; Pasaniuc, B.; Penninx, B. W.; Langefeld, C. D.; Lind, Lars; Tzourio, C.; Fava, Cristiano; Baldassarre, D.; O’Leary, D. H.; Teupser, D.; Kuh, D.; Tremoli, E.; Mannarino, E.; Grossi, E.; Boerwinkle, E.; Schadt, E. E.; Ingelsson, Erik, ...; Veglia, F.; Rivadeneira, F.; Beutner, F.; Chauhan, G.; Heiss, G.; Snieder, H.; Campbell, H.; Völzke, H.; Markus, H. S.; Deary, I. J.; Jukema, J. W.; de Graaf, J.; Price, J.; Pott, J.; Hopewell, J. C.; Liang, J.; Thiery, J.; Engmann, J.; Gertow, K.; Rice, K.; Taylor, K. D.; Dhana, K.; Lindgren, Arne; Lind, L.; Raffield, L. M.; Launer, L. J.; Holdt, L. M.; Dörr, M.; Dichgans, M.; Traylor, M.; Sitzer, M.; Kumari, M.; Kivimaki, M.; Nalls, M. A.; Melander, Olle; Raitakari, O.; Franco, O. H.; Rueda-Ochoa, O. ...; Roussos, P.; Whincup, P. H.; Amouyel, P.; Giral, P.; Anugu, P.; Wong, Q.; Malik, R.; Rauramaa, R.; Burkhardt, R.; Hardy, R.; Schmidt, R.; de Mutsert, R.; Morris, R. W.; Strawbridge, R. ...; Wannamethee, S. ...; Hägg, S.; Shah, S.; McLachlan, S.; Trompet, S.; Seshadri, S.; Kurl, S.; Heckbert, S. R.; Ring, S.; Harris, T. B.; Lehtimäki, T.; Galesloot, T. E.; Shah, T.; de Faire, U.; Plagnol, V.; Rosamond, W. D.; Post, W.; Zhu, X.; Zhang, X.; Guo, X.; Saba, Y.; Okada, Y.; Mishra, A.; Rutten-Jacobs, L ...; Giese, A. K.; van der Laan, S. ...; Gretarsdottir, S ...; Anderson, C. D.; Chong, M.; Adams, H. H. H.; Ago, T.; Almgren, P.; Ay, H.; Bartz, T. M.; Benavente, O. R.; Bevan, S.; Boncoraglio, G. ...; Brown, Jr.; Butterworth, A. ...; Carrera, C.; Carty, C. L.; Chasman, D. I.; Chen, W. M.; Cole, J. W.; Cotlarciuc, I.; Cruchaga, C.; Danesh, J.; de Bakker, P. I. ...; DeStefano, A. L.; den Hoed, M.; Duan, Q.; Engelter, S. T.; Falcone, G. J.; Gottesman, R. F.; Grewal, R. P.; Gustafsson, S.; Haessler, J.; Hassan, A.; Havulinna, A. S.; Holliday, E. G.; Howard, G.; Hsu, F. C.; Hyacinth, H. I.; Ikram, M. A.; Irvin, M. R.; Jian, X.; Jiménez-Conde, J ...; Johnson, J. A.; Kanai, M.; Keene, K. L.; Kissela, B. M.; Kleindorfer, D. ...; Kooperberg, C.; Kubo, M.; Lange, L.; Langenberg, C.; Lee, J. M.; Lemmens, R.; Leys, D.; Lewis, C. M.; Lin, W. Y.; Lindgren, A. G.; Lorentzen, Erik, ...; Magnusson, P. K.; Maguire, J.; Manichaikul, A.; McArdle, P. F.; Meschia, J. F.; Mosley, T. H.; Ninomiya, T.; O’Donnell, M. J.; Pulit, S. L.; Rannikmäe, K.; Reiner, A. P.; Rexrode, K. M.; Rich, S. S.; Ridker, P. M.; Rost, N. S.; Rothwell, P. M.; Rundek, T.; Sacco, R. L.; Sakaue, S.; Sale, M. M.; Salomaa, V.; Sapkota, B. R.; Schmidt, C. O.; Sharma, P.; Slowik, A.; Sudlow, C. L. M.; Tanislav, C.; Thijs, V. N. S.; Thorleifsson, G.; Thorsteinsdottir ...; Tiedt, S.; Walters, M.; Wareham, N. J.; Wassertheil-Smol ...; Wiggins, K. L.; Yang, Q.; Yusuf, S.; Pastinen, T.; Koplev, S.; Codoni, V.; Civelek, M.; Smith, N.; Trégouët, D. A.; Christophersen, ...; Roselli, C.; Lubitz, S. A.; Ellinor, P. T.; Tai, E. S.; Kooner, J. S.; Kato, N.; He, J.; van der Harst, P ...; Elliott, P.; Chambers, J. C.; Takeuchi, F.; Johnson, A. D.; Sanghera, D. K.; Melander, O.; Strbian, D.; Fernandez-Cadena ...; Longstreth, Jr.; Rolfs, A.; Hata, J.; Woo, D.; Rosand, J.; Pare, G.; Saleheen, D.; Stefansson, K.; Worrall, B. B.; Kittner, S. J.; Howson, J. M. M.; Kamatani, Y.; Dehghan, A.; Seldenrijk, A.; Morrison, A. C.; Hamsten, A.; Psaty, B. M.; van Duijn, C. M.; Lawlor, D. A.; Mook-Kanamori, D ...; Bowden, D. W.; Schmidt, H.; Wilson, J. F.; Wilson, J. G.; Rotter, J. I.; Wardlaw, J. M.; Deanfield, J.; Halcox, J.; Lyytikäinen, L. ...; Loeffler, M.; Evans, M. K.; Debette, S.; Humphries, S. E.; Völker, U.; Gudnason, V.; Hingorani, A. D.; Björkegren, J. L ...; Casas, J. P.; O’Donnell, C. J.; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Kardiologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin

Artiklar i publikationen: Nature Communica ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se