SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Woessmann Jakob)
 

Sökning: WFRF:(Woessmann Jakob) > Addressing the Prot...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003840naa a2200757 4500
001oai:DiVA.org:kth-327264
003SwePub
008230524s2022 | |||||||||||000 ||eng|
024a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-3272642 URI
024a https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c004912 DOI
040 a (SwePub)kth
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
100a Woessmann, Jakobu KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap4 aut0 (Swepub:kth)PI000000
2451 0a Addressing the Protease Bias in Quantitative Proteomics
264 c 2022-08-31
264 1b American Chemical Society (ACS),c 2022
338 a print2 rdacarrier
500 a QC 20230524
520 a Protein quantification strategies using multiple proteases have been shown to deliver poor interprotease accuracy in label-free mass spectrometry experiments. By utilizing six different proteases with different cleavage sites, this study explores the protease bias and its effect on accuracy and precision by using recombinant protein standards. We established 557 SRM assays, using a recombinant protein standard resource, toward 10 proteins in human plasma and determined their concentration with multiple proteases. The quantified peptides of these plasma proteins spanned 3 orders of magnitude (0.02-70 μM). In total, 60 peptides were used for absolute quantification and the majority of the peptides showed high robustness. The retained reproducibility was achieved by quantifying plasma proteins using spiked stable isotope standard recombinant proteins in a targeted proteomics workflow. 
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
653 a absolute quantification
653 a multiple proteases
653 a plasma proteomics
653 a SRM
653 a targeted proteomics
653 a Blood Proteins
653 a Endopeptidases
653 a Humans
653 a Isotope Labeling
653 a Isotopes
653 a Peptide Hydrolases
653 a Peptides
653 a Proteomics
653 a Recombinant Proteins
653 a Reproducibility of Results
653 a peptide
653 a plasma protein
653 a proteinase
653 a recombinant protein
653 a stable isotope
653 a isotope
653 a peptide hydrolase
653 a Article
653 a controlled study
653 a female
653 a human
653 a kernel method
653 a male
653 a mass spectrometry
653 a plasma
653 a quantitative analysis
653 a reproducibility
653 a procedures
700a Kotol, Davidu KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap4 aut0 (Swepub:kth)u1yd1hdh
700a Hober, Andreas,d 1992-u KTH,Proteinvetenskap,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:kth)u15bkxsl
700a Uhlén, Mathiasu KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap4 aut0 (Swepub:kth)u1dulvmw
700a Edfors, Fredriku KTH,Proteinvetenskap,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:kth)u149ml0e
710a KTHb Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 org
773t Journal of Proteome Researchd : American Chemical Society (ACS)g 21:10, s. 2526-2534q 21:10<2526-2534x 1535-3893x 1535-3907
856u https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c00491y Fulltext
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-327264
8564 8u https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.2c00491

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy