SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Åqvist Johan 1959 )
 

Sökning: WFRF:(Åqvist Johan 1959 ) > (2009) > Protein autoproteol...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00005654naa a2200637 4500
001oai:gup.ub.gu.se/104202
003SwePub
008240910s2009 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:slubar.slu.se:27202
009oai:DiVA.org:uu-128356
0247 a https://gup.ub.gu.se/publication/1042022 URI
0247 a https://doi.org/10.1021/ja90108172 DOI
0247 a https://res.slu.se/id/publ/272022 URI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-1283562 URI
040 a (SwePub)gud (SwePub)slud (SwePub)uu
041 a eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Johansson, Denny,d 1980u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology4 aut0 (Swepub:gu)xjohde
2451 0a Protein autoproteolysis: conformational strain linked to the rate of peptide cleavage by the pH dependence of the N --> O acyl shift reaction.
264 c 2009-06-17
264 1b American Chemical Society (ACS),c 2009
520 a Nucleophilic attack by a side chain nucleophile on the adjacent peptide bond followed by N --> O or N --> S acyl shift is the primary step in protein autoproteolysis. Precursor structures of autoproteolytic proteins reveal strained (or twisted) amides at the site of cleavage, and we previously showed that SEA domain autoproteolysis involves substrate destabilization by approximately 7 kcal/mol. However, the precise chemical mechanism by which conformational energy is converted into reaction rate acceleration has not been understood. Here we show that the pH dependence of autoproteolysis in a slow-cleaving mutant (1G) of the MUC1 SEA domain is consistent with a mechanism in which N --> O acyl shift proceeds after initial protonation of the amide nitrogen. Unstrained amides have pK(a) values of 0 with protonation on the oxygen, and autoproteolysis is therefore immeasurably slow at neutral pH. However, conformational strain forces the peptide nitrogen into a pyramidal conformation with a significantly increased pK(a) for protonation. We find that pK(a) values of approximately 4 and approximately 6, as in model compounds of twisted amides, reproduce the rate of autoproteolysis in the 1G and wild-type SEA domains, respectively. A mechanism involving strain, nitrogen protonation, and N --> O shift is also supported by quantum-chemical calculations. Such a reaction therefore constitutes an alternative to peptide cleavage that is utilized in autoproteolysis, as opposed to a classical mechanism involving a structurally conserved active site with a catalytic triad and an oxyanion hole, which are not present at the SEA domain cleavage site.
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biokemi och molekylärbiologi0 (SwePub)106022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biochemistry and Molecular Biology0 (SwePub)106022 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Kemix Fysikalisk kemi0 (SwePub)104022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Chemical Sciencesx Physical Chemistry0 (SwePub)104022 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologi0 (SwePub)1062 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciences0 (SwePub)1062 hsv//eng
653 a Hydrogen-Ion Concentration
653 a Nitrogen
653 a chemistry
653 a Oxygen
653 a chemistry
653 a Peptides
653 a chemistry
653 a Protein Conformation
653 a Proteins
653 a chemistry
653 a Quantum Theory
653 a Biology
7001 a Wallin, Göranu Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi4 aut
7001 a Sandberg, Anders,d 1975u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology4 aut
7001 a Macao, Bertil,d 1969u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology4 aut0 (Swepub:gu)xmacbe
7001 a Åqvist, Johanu Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi4 aut0 (Swepub:uu)johanaq
7001 a Härd, Torleif,d 1959u Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology,Institutionen för molekylärbiologi,Department of Molecular Biology,University of Gothenburg4 aut0 (Swepub:slu)50056
7102 a Göteborgs universitetb Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi4 org
7102 a Sveriges lantbruksuniversitet
7730 t Journal of the American Chemical Societyd : American Chemical Society (ACS)g 131:27, s. 9475-7q 131:27<9475-7x 1520-5126x 0002-7863
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/104202
8564 8u https://doi.org/10.1021/ja9010817
8564 8u https://res.slu.se/id/publ/27202
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-128356

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy