SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Isaksson Margareth)
 

Sökning: WFRF:(Isaksson Margareth) > Gene expression and...

  • Bartuma, HammurabiLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine (författare)

Gene expression and single nucleotide polymorphism array analyses of spindle cell lipomas and conventional lipomas with 13q14 deletion.

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011-05-11
  • Wiley,2011

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:e0337c01-e201-4173-bdd2-85f0f8b9e3a4
  • https://lup.lub.lu.se/record/1972882URI
  • https://doi.org/10.1002/gcc.20884DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Spindle cell lipomas (SCL) are circumscribed, usually s.c. tumors that typically occur on the posterior neck, shoulder, and back of middle aged men. Cytogenetically, almost all SCL are characterized by deletions of chromosome arm 13q, often in combination with loss of 16q. Deletions of 13q are seen also in approximately 15% of conventional lipomas. Through single nucleotide polymorphism (SNP) array analyses, we identified two minimal deleted regions (MDR) in 13q14 in SCL. In MDR1, four genes were located, including the tumor suppressor gene RB1. MDR1 in SCL overlapped with the MDR detected in conventional lipomas with 13q14 deletion. In MDR2 in SCL there were 34 genes and the two microRNA (miRNA) genes miR-15a and miR-16-1. Global gene expression analysis was used to study the impact of the deletions on genes mapping to the two SCL-associated MDR. Five genes (C13orf1, DHRS12, ATP7B, ALG11, and VPS36) in SCL and one gene (C13orf1) in conventional lipomas with 13q-deletions were found to be significantly underexpressed compared with control tissues. Quantitative real-time PCR showed that miR-16-1 was expressed at lower levels in SCL than in the control samples. No mutations were found at sequencing of RB1, miR-15a, and miR-16-1. Our findings further delineate the target region for the 13q deletion in SCL and conventional lipomas and show that the deletions are associated with down-regulated expression of several genes, notably C13orf1, which was the only gene to be significantly down-regulated in both tumor types. © 2011 Wiley-Liss, Inc.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Hansén Nord, KarolinLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)klin-kha (författare)
  • Macchia, Gemma (författare)
  • Isaksson, MargarethLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)kgen-mis (författare)
  • Nilsson, JennyLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-jno (författare)
  • Domanski, HenrykLund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)pat-hdo (författare)
  • Mandahl, NilsLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)kgen-nma (författare)
  • Mertens, FredrikLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)kgen-fme (författare)
  • Avdelningen för klinisk genetikInstitutionen för laboratoriemedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genes, Chromosomes and Cancer: Wiley50, s. 619-6321045-2257

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy