SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Herrmann Eva)
 

Sökning: WFRF:(Herrmann Eva) > Disordered Regions ...

  • Karlsson, ElinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (författare)

Disordered Regions Flanking the Binding Interface Modulate Affinity between CBP and NCOA

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier,2022
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-479906
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-479906URI
  • https://doi.org/10.1016/j.jmb.2022.167643DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Recognition motifs that mediate protein-protein interactions are usually embedded within longer intrinsically disordered regions. While binding interfaces involving the recognition motif in such interactions are well studied, less is known about the role of disordered regions flanking the motifs. The interaction between the transcriptional co-activators NCOA3 (ACTR) and CBP is mediated by coupled binding and folding of the two domains CID and NCBD. Here, we used circular dichroism and kinetics to directly quantify the contribution of the adjacent flanking regions of CID to its interaction with NCBD. Using N-and C terminal combinatorial variants we found that the flanking regions promote binding in an additive fashion while retaining a large degree of disorder in the complex. Experiments at different ionic strengths demonstrated that the increase in affinity is not mediated by electrostatic interactions from the flanking regions. Instead, site-directed mutagenesis and molecular dynamics simulations suggest that binding is promoted by short-lived non-specific hydrophobic contacts between the flanking regions and NCBD. Our findings are consistent with highly frustrated interactions outside of the canonical binding interface resulting in a slightly energetically favorable fuzzy binding. Modulation of affinity via flanking regions could represent a general mechanism for functional regulation by intrinsically disordered protein regions.(c) 2022 The Author(s). Published by Elsevier Ltd. This is an open access article under the CC BY license (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Schnatwinkel, JanUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Ruhr Univ Bochum, Fac Chem & Biochem, Dept Phys Chem 1, D-44780 Bochum, Germany. (författare)
  • Paissoni, CristinaUniv Milan, Dipartimento Biosci, I-20133 Milan, Italy. (författare)
  • Andersson, EvaUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)ean20137 (författare)
  • Herrmann, ChristianRuhr Univ Bochum, Fac Chem & Biochem, Dept Phys Chem 1, D-44780 Bochum, Germany. (författare)
  • Camilloni, CarloUniv Milan, Dipartimento Biosci, I-20133 Milan, Italy. (författare)
  • Jemth, PerUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)pje13912 (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Molecular Biology: Elsevier434:130022-28361089-8638

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy