SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Holden L)
 

Sökning: WFRF:(Holden L) > Predicting the viru...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00004397naa a2200745 4500
001oai:gup.ub.gu.se/198744
003SwePub
008240528s2014 | |||||||||||000 ||eng|
024a https://gup.ub.gu.se/publication/1987442 URI
024a https://doi.org/10.1101/gr.165415.1132 DOI
040 a (SwePub)gu
041 a eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
100a Laabei, M.4 aut
2451 0a Predicting the virulence of MRSA from its genome sequence
264 c 2014-04-09
264 1b Cold Spring Harbor Laboratory,c 2014
338 a electronic2 rdacarrier
520 a Microbial virulence is a complex and often multifactorial phenotype, intricately linked to a pathogen's evolutionary trajectory. Toxicity, the ability to destroy host cell membranes, and adhesion, the ability to adhere to human tissues, are the major virulence factors of many bacterial pathogens, including Staphylococcus aureus. Here, we assayed the toxicity and adhesiveness of 90 MRSA (methicillin resistant S. aureus) isolates and found that while there was remarkably little variation in adhesion, toxicity varied by over an order of magnitude between isolates, suggesting different evolutionary selection pressures acting on these two traits. We performed a genome-wide association study (GWAS) and identified a large number of loci, as well as a putative network of epistatically interacting loci, that significantly associated with toxicity. Despite this apparent complexity in toxicity regulation, a predictive model based on a set of significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertion and deletions events (indels) showed a high degree of accuracy in predicting an isolate's toxicity solely from the genetic signature at these sites. Our results thus highlight the potential of using sequence data to determine clinically relevant parameters and have further implications for understanding the microbial virulence of this opportunistic pathogen.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Mikrobiologi inom det medicinska området0 (SwePub)301092 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Microbiology in the medical area0 (SwePub)301092 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Medicinsk genetik0 (SwePub)301072 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Medical Genetics0 (SwePub)301072 hsv//eng
653 a RESISTANT STAPHYLOCOCCUS-AUREUS
653 a MYCOBACTERIUM-TUBERCULOSIS
653 a EVOLUTION
653 a IDENTIFICATION
653 a EXPRESSION
653 a GENE
653 a BIOSYNTHESIS
653 a MICROBIOLOGY
653 a TRANSMISSION
700a Recker, M.4 aut
700a Rudkin, J. K.4 aut
700a Aldeljawi, M.4 aut
700a Gulay, Z.4 aut
700a Sloan, T. J.4 aut
700a Williams, P.4 aut
700a Endres, J. L.4 aut
700a Bayles, K. W.4 aut
700a Fey, P. D.4 aut
700a Yajjala, V. K.4 aut
700a Widhelm, T.4 aut
700a Hawkins, E.4 aut
700a Lewis, K.4 aut
700a Parfett, S.4 aut
700a Scowen, L.4 aut
700a Peacock, S. J.4 aut
700a Holden, M.4 aut
700a Wilson, D.4 aut
700a Read, T. D.4 aut
700a van den Elsen, J.4 aut
700a Priest, N. K.4 aut
700a Feil, E. J.4 aut
700a Hurst, L. D.4 aut
700a Josefsson, Elisabet,d 1966u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för reumatologi och inflammationsforskning,Institute of Medicine, Department of Rheumatology and Inflammation Research4 aut0 (Swepub:gu)xjosel
700a Massey, R. C.4 aut
710a Göteborgs universitetb Institutionen för medicin, avdelningen för reumatologi och inflammationsforskning4 org
773t Genome Researchd : Cold Spring Harbor Laboratoryg 24:5, s. 839-849q 24:5<839-849x 1088-9051
856u https://gup.ub.gu.se/publication/198744x primaryx freey FULLTEXT
856u http://genome.cshlp.org/content/24/5/839.full.pdf
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/198744
8564 8u https://doi.org/10.1101/gr.165415.113

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy