SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Moens Lotte)
 

Sökning: WFRF:(Moens Lotte) > Mutation patterns i...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00007606naa a2200781 4500
001oai:DiVA.org:uu-380587
003SwePub
008190329s2019 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:DiVA.org:su-168651
009oai:prod.swepub.kib.ki.se:140687514
009oai:lup.lub.lu.se:b6f78d0a-74ab-4af1-a7f9-5057650e1a4a
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-3805872 URI
0247 a https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2019.01.0032 DOI
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-1686512 URI
0247 a http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:1406875142 URI
0247 a https://lup.lub.lu.se/record/b6f78d0a-74ab-4af1-a7f9-5057650e1a4a2 URI
040 a (SwePub)uud (SwePub)sud (SwePub)kid (SwePub)lu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a La Fleur, Linneau Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Johan Botling4 aut0 (Swepub:uu)linla513
2451 0a Mutation patterns in a population-based non-small cell lung cancer cohort and prognostic impact of concomitant mutations in KRAS and TP53 or STK11
264 1b Elsevier BV,c 2019
338 a electronic2 rdacarrier
520 a OBJECTIVES: Non-small cell lung cancer (NSCLC) is a heterogeneous disease with unique combinations of somatic molecular alterations in individual patients, as well as significant differences in populations across the world with regard to mutation spectra and mutation frequencies. Here we aim to describe mutational patterns and linked clinical parameters in a population-based NSCLC cohort.MATERIALS AND METHODS: Using targeted resequencing the mutational status of 82 genes was evaluated in a consecutive Swedish surgical NSCLC cohort, consisting of 352 patient samples from either fresh frozen or formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissues. The panel covers all exons of the 82 genes and utilizes reduced target fragment length and two-strand capture making it compatible with degraded FFPE samples.RESULTS: We obtained a uniform sequencing coverage and mutation load across the fresh frozen and FFPE samples by adaption of sequencing depth and bioinformatic pipeline, thereby avoiding a technical bias between these two sample types. At large, the mutation frequencies resembled the frequencies seen in other western populations, except for a high frequency of KRAS hotspot mutations (43%) in adenocarcinoma patients. Worse overall survival was observed for adenocarcinoma patients with a mutation in either TP53, STK11 or SMARCA4. In the adenocarcinoma KRAS-mutated group poor survival appeared to be linked to concomitant TP53 or STK11 mutations, and not to KRAS mutation as a single aberration. Similar results were seen in the analysis of publicly available data from the cBioPortal. In squamous cell carcinoma a worse prognosis could be observed for patients with MLL2 mutations, while CSMD3 mutations were linked to a better prognosis.CONCLUSION: Here we have evaluated the mutational status of a NSCLC cohort. We could not confirm any survival impact of isolated driver mutations. Instead, concurrent mutations in TP53 and STK11 were shown to confer poor survival in the KRAS-positive adenocarcinoma subgroup.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Klinisk laboratoriemedicin0 (SwePub)302232 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Clinical Laboratory Medicine0 (SwePub)302232 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Cancer och onkologi0 (SwePub)302032 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Cancer and Oncology0 (SwePub)302032 hsv//eng
653 a KRAS
653 a Mutation patterns
653 a Non-small cell lung cancer
653 a STK11
653 a TP53
653 a Targeted resequencing
653 a Patologi
653 a Pathology
653 a KRAS
653 a Mutation patterns
653 a Non-small cell lung cancer
653 a STK11
653 a Targeted resequencing
653 a TP53
7001 a Falk-Sörqvist, Elinu Uppsala University,Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)elifa876
7001 a Smeds, Patriku Uppsala University,Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:uu)patsm159
7001 a Berglund, Andersu EpiStat (Epidemiology & Statistics Consulting) Sweden4 aut
7001 a Sundström, Magnusu Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Johan Botling4 aut0 (Swepub:uu)magnsund
7001 a Mattsson, Johanna Sofia Margareta,d 1985-u Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Patrick Micke4 aut0 (Swepub:uu)johma961
7001 a Brandén, Evau Uppsala University,Uppsala universitet,Centrum för klinisk forskning, Gävleborg,Dept. of Respiratory Medicine, Gävle Hospital, Gävle4 aut0 (Swepub:uu)evabr789
7001 a Koyi, Hirshu Uppsala University,Karolinska Institutet,Uppsala universitet,Centrum för klinisk forskning, Gävleborg,Dept. of Respiratory Medicine, Gävle Hospital, Gävle4 aut0 (Swepub:uu)hirko843
7001 a Isaksson, Johanu Uppsala University,Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Klinisk och experimentell patologi,Centrum för klinisk forskning, Gävleborg,Dept. of Respiratory Medicine, Gävle Hospital, Gävle4 aut0 (Swepub:uu)johis237
7001 a Brunnström, Hansu Lund University,Lunds universitet,Förbättrad diagnostik och prognostik vid lungcancer och metastaser till lunga,Forskargrupper vid Lunds universitet,Improved diagnostics and prognostics of lung cancer and metastases to the lungs,Lund University Research Groups4 aut0 (Swepub:lu)med-hsb
7001 a Nilsson, Matsu Stockholm University,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik4 aut0 (Swepub:lu)ma6088ni
7001 a Micke, Patricku Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Patrick Micke4 aut0 (Swepub:uu)patmi676
7001 a Moens, Lotteu Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Johan Botling4 aut0 (Swepub:uu)lotmo617
7001 a Botling, Johanu Uppsala University,Uppsala universitet,Klinisk och experimentell patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Johan Botling4 aut0 (Swepub:uu)johanbot
7102 a Uppsala universitetb Klinisk och experimentell patologi4 org
7730 t Lung Cancerd : Elsevier BVg 130, s. 50-58q 130<50-58x 0169-5002x 1872-8332
8564 u https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2019.01.003y Fulltext
8564 u https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1300619/FULLTEXT01.pdfx primaryx Raw objecty fulltext:print
8564 u http://www.lungcancerjournal.info/article/S0169500219300054/pdf
8564 u http://dx.doi.org/10.1016/j.lungcan.2019.01.003x freey FULLTEXT
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-380587
8564 8u https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2019.01.003
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-168651
8564 8u http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:140687514
8564 8u https://lup.lub.lu.se/record/b6f78d0a-74ab-4af1-a7f9-5057650e1a4a

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy