SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Garcia Bonete Maria Jose 1989)
 

Sökning: WFRF:(Garcia Bonete Maria Jose 1989) > Deciphering peptide...

Deciphering peptide-protein interactions via composition-based prediction: a case study with survivin/BIRC5

Larasati Anindya, Atsarina (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
Nur Olsson, Torbjörn (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
Jensen, Maja, 1978 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
visa fler...
Garcia-Bonete, Maria-Jose, 1989 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
Wheatley, Sally P. (författare)
Bokarewa, Maria (författare)
Mezzasalma, Stefano A. (författare)
Katona, Gergely, 1975 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2024
2024
Engelska.
Ingår i: MACHINE LEARNING-SCIENCE AND TECHNOLOGY. - 2632-2153. ; 5:2
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • In the realm of atomic physics and chemistry, composition emerges as the most powerful means of describing matter. Mendeleev's periodic table and chemical formulas, while not entirely free from ambiguities, provide robust approximations for comprehending the properties of atoms, chemicals, and their collective behaviours, which stem from the dynamic interplay of their constituents. Our study illustrates that protein-protein interactions follow a similar paradigm, wherein the composition of peptides plays a pivotal role in predicting their interactions with the protein survivin, using an elegantly simple model. An analysis of these predictions within the context of the human proteome not only confirms the known cellular locations of survivin and its interaction partners, but also introduces novel insights into biological functionality. It becomes evident that electrostatic- and primary structure-based descriptions fall short in predictive power, leading us to speculate that protein interactions are orchestrated by the collective dynamics of functional groups.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)

Nyckelord

composition-based prediction
multilayer perceptrons
classification
feature engineering
protein interactions
survivin
phase transition

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy