SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Nguyen Helen C)
 

Sökning: WFRF:(Nguyen Helen C) > Disruption of Highe...

  • Bergquist, HelenUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Karolinska Inst, Dept Lab Med, Clin Res Ctr, SE-14186 Huddinge, Sweden. (författare)

Disruption of Higher Order DNA Structures in Friedreich's Ataxia (GAA)(n) Repeats by PNA or LNA Targeting

  • Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-11-15
  • PLOS,2016
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-199545
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-199545URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0165788DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:134728853URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-312088URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20170116
  • Expansion of (GAA)(n) repeats in the first intron of the Frataxin gene is associated with reduced mRNA and protein levels and the development of Friedreich's ataxia. (GAA)(n) expansions form non-canonical structures, including intramolecular triplex (H-DNA), and Rloops and are associated with epigenetic modifications. With the aim of interfering with higher order H-DNA (like) DNA structures within pathological (GAA)(n) expansions, we examined sequence-specific interaction of peptide nucleic acid (PNA) with (GAA)(n) repeats of different lengths (short: n= 9, medium: n= 75 or long: n= 115) by chemical probing of triple helical and single stranded regions. We found that a triplex structure (H-DNA) forms at GAA repeats of different lengths; however, single stranded regions were not detected within the medium size pathological repeat, suggesting the presence of a more complex structure. Furthermore, (GAA) 4-PNA binding of the repeat abolished all detectable triplex DNA structures, whereas (CTT) 5-PNA did not. We present evidence that (GAA) 4-PNA can invade the DNA at the repeat region by binding the DNA CTT strand, thereby preventing non-canonical-DNA formation, and that triplex invasion complexes by (CTT) 5-PNA form at the GAA repeats. Locked nucleic acid (LNA) oligonucleotides also inhibited triplex formation at GAA repeat expansions, and atomic force microscopy analysis showed significant relaxation of plasmid morphology in the presence of GAA-LNA. Thus, by inhibiting disease related higher order DNA structures in the Frataxin gene, such PNA and LNA oligomers may have potential for discovery of drugs aiming at recovering Frataxin expression.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Rocha, Cristina S. J.Karolinska Inst, Dept Lab Med, Clin Res Ctr, SE-14186 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Alvarez-Asencio, RubenKTH,Kemi,Universitario de Cantoblanco, Spain,KTH Royal Inst Technol, Sch Chem Sci & Engn, Dept Chem, Stockholm, Sweden.;Fdn IMDEA Nanociencia, 9 Campus Univ Cantoblanco, Madrid, Spain.(Swepub:kth)u1u6jl5f (författare)
  • Nguyen, Chi-Hung (författare)
  • Rutland, Mark W.KTH,Kemi,KTH Royal Inst Technol, Sch Chem Sci & Engn, Dept Chem, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1ml9bxf (författare)
  • Smith, C. I. EdvardKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Lab Med, Clin Res Ctr, SE-14186 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Good, LiamUniv London, Dept Pathol & Infect Dis, Royal Vet Coll, London WC1E 7HU, England. (författare)
  • Nielsen, Peter E.Univ Copenhagen, Panum Inst, Fac Hlth & Med Sci, Dept Cellular & Mol Med, Copenhagen, Denmark. (författare)
  • Zain, RulaKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Lab Med, Clin Res Ctr, SE-14186 Huddinge, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Ctr Rare Dis, SE-17176 Stockholm, Sweden. (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLOS ONE: PLOS11:111932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy